RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	18.54	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	IFNK	Q9P0W0	207 aa		18.54	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	18.54	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		18.54	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	18.54	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	18.53	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	ERBB2	P04626	1255 aa		18.53	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	CCDC172	P0C7W6	258 aa		18.53	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	18.53	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	18.53	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	GAD2	Q05329	585 aa		18.53	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		18.53	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		18.53	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	NAA35	Q5VZE5	725 aa		18.53	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	18.53	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		18.53	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		18.53	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	TMEM25	Q86YD3	366 aa		18.53	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		18.53	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	CD101	Q93033	1021 aa		18.53	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	PLD4	Q96BZ4	506 aa		18.53	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		18.53	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		18.53	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		18.53	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	PROB1	E7EW31	1015 aa		18.52	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	18.52	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	GREM1	O60565	184 aa		18.52	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	GRAP2	O75791	330 aa		18.52	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	18.52	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	KLKB1	P03952	638 aa		18.52	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	FYN	P06241	537 aa		18.52	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	CHRNB1	P11230	501 aa		18.52	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	FER	P16591	822 aa		18.52	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	TAF5	Q15542	800 aa		18.52	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		18.52	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		18.52	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		18.52	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	NAT16	Q8N8M0	369 aa		18.52	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	ADAM32	Q8TC27	787 aa		18.52	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	BHMT	Q93088	406 aa		18.52	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	CLDN23	Q96B33	292 aa		18.52	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	C18orf8	Q96DM3	657 aa		18.52	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	18.52	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	BBS2	Q9BXC9	721 aa		18.52	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		18.52	■□□□□ 0.56
USP19-210	ENST00000465902	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		18.51	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	TPM3	P06753	285 aa		18.51	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	CHRNB2	P17787	502 aa		18.51	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	18.51	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	MAGEA9	P43362	315 aa		18.51	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	18.51	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	TBX4	P57082	545 aa		18.51	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	18.51	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	NOMO3	P69849	1222 aa		18.51	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	FMO1	Q01740	532 aa		18.51	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	FZD5	Q13467	585 aa		18.51	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	18.51	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	C2CD6	Q53TS8	623 aa		18.51	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	DCAF6	Q58WW2	860 aa		18.51	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		18.51	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		18.51	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		18.51	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902		Q6ZNB5	142 aa		18.51	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		18.51	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	18.51	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	18.51	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	18.51	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	LRRC53	A6NM62	1247 aa		18.5	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	HSF2BP	O75031	334 aa		18.5	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	EGF	P01133	1207 aa		18.5	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	GLI1	P08151	1106 aa		18.5	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	DRD1	P21728	446 aa		18.5	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	CHKA	P35790	457 aa		18.5	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	NBL1	P41271	181 aa		18.5	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	SLC6A11	P48066	632 aa		18.5	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	SLC6A3	Q01959	620 aa		18.5	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	ANGPT1	Q15389	498 aa		18.5	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	ASIC2	Q16515	512 aa		18.5	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		18.5	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		18.5	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		18.5	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		18.5	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	DEFB106A	Q8N104	65 aa		18.5	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		18.5	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	BAP1	Q92560	729 aa		18.5	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	SERPINB11	Q96P15	392 aa		18.5	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	AGPAT1	Q99943	283 aa		18.5	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	NUP58	Q9BVL2	599 aa		18.5	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		18.5	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	MYO6	Q9UM54	1294 aa		18.5	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	USP34	Q70CQ2	3546 aa		18.5	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	18.5	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		18.49	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		18.49	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	LAMTOR5	O43504	91 aa		18.49	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	TYR	P14679	529 aa		18.49	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	OPRD1	P41143	372 aa		18.49	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	ZNF445	P59923	1031 aa		18.49	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	CDK17	Q00537	523 aa		18.49	■□□□□ 0.55
USP19-210	ENST00000465902	KDSR	Q06136	332 aa		18.49	■□□□□ 0.55

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