RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	PRKCH	P24723	683 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	GCA	P28676	217 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	ELK3	P41970	407 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	GLUD2	P49448	558 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	FCGRT	P55899	365 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	GPX6	P59796	221 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	COG7	P83436	770 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	SCAP	Q12770	1279 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	PTK7	Q13308	1070 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	SEMA5A	Q13591	1074 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	UBXN11	Q5T124	520 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	PQLC3	Q8N755	202 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	ATP2A3	Q93084	1043 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	NT5C3B	Q969T7	300 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	APOPT1	Q96IL0	206 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	DONSON	Q9NYP3	566 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	FZD10	Q9ULW2	581 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758		A0A0A0MRY4	1105 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	KLF11	O14901	512 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	LPXN	O60711	386 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF623	O75123	536 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	CABYR	O75952	493 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM63A	O94886	807 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	TGDS	O95455	350 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	APOE	P02649	317 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	APRT	P07741	180 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	PDGFRB	P09619	1106 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC130	P13994	396 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	TAC1	P20366	129 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	IL4R	P24394	825 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	AKAP5	P24588	427 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	RBL1	P28749	1068 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	SSTR1	P30872	391 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	DEUP1	Q05D60	604 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	CDK18	Q07002	472 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	MMRN1	Q13201	1228 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	LRRC14	Q15048	493 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	ATG16L1	Q676U5	607 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	TRNP1	Q6NT89	227 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	RGMB	Q6NW40	437 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	PIGZ	Q86VD9	579 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	IFNL1	Q8IU54	200 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	CYP4X1	Q8N118	509 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC63	Q8NA47	563 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	GDAP1	Q8TB36	358 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	PWWP2A	Q96N64	755 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	SPATA13	Q96N96	652 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	NPY6R	Q99463	290 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	KBTBD13	C9JR72	458 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758		I3L4J1	428 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	IGHA2	P01877	340 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	RARB	P10826	455 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	NEFH	P12036	1026 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	CYP2B6	P20813	491 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC18A2	Q05940	514 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	ADIG	Q0VDE8	80 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	RIPK1	Q13546	671 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	TAF5	Q15542	800 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	PARP6	Q2NL67	630 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms