RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 CYP1B1Q16678 543 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 BOLA3Q53S33 107 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 C9orf57Q5W0N0 161 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 NXNQ6DKJ4 435 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 VSTM1Q6UX27 236 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 RSPH3Q86UC2 560 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 TRIM74Q86UV6 250 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 TRIM73Q86UV7 250 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 IGDCC3Q8IVU1 814 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 FBXO41Q8TF61 875 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 RMDN2Q96LZ7 410 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 RNF157Q96PX1 679 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 MYO7AQ13402 2215 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 FOXN2P32314 431 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 LAMB3Q13751 1172 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 MIB1Q86YT6 1006 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 SGF29Q96ES7 293 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 IPPQ9Y573 584 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 CDY2AQ9Y6F7 541 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 LTBP3Q9NS15 1303 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 SPTLC1O15269 473 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 KRT37O76014 449 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM200BP0CF97 657 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 IVDP26440 423 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 CD52P31358 61 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 AVPR1AP37288 418 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 GHRHRQ02643 423 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 BBS12Q6ZW61 710 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 CYP3A43Q9HB55 503 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 PCDH18Q9HCL0 1135 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 ZFP69BQ9UJL9 534 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 ARHGAP42A6NI28 874 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 RRN3P2A6NIE6 340 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 LGR5O75473 907 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 FGFR1P11362 822 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 OR1G1P47890 313 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 KLHL38Q2WGJ6 581 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 HFE2Q6ZVN8 426 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 NUDCD3Q8IVD9 361 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 PARP9Q8IXQ6 854 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 DTX3LQ8TDB6 740 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 SENP8Q96LD8 212 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 LTBP1Q14766 1721 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 PMM2O15305 246 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 MGAT1P26572 445 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 BST2Q10589 180 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 CYB5D1Q6P9G0 228 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 PCDH19Q8TAB3 1148 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 PAAF1Q9BRP4 392 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 C2CD2LO14523 706 aa14.02□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 BAG2O95816 211 aa14.02□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 BCAT1P54687 386 aa14.02□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa14.02□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC25A41Q8N5S1 370 aa14.02□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 PLD5Q8N7P1 536 aa14.02□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa14.02□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 MCUQ8NE86 351 aa14.02□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 PTPN18Q99952 460 aa14.02□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa14.02□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 STAP1Q9ULZ2 295 aa14.02□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa14.02□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 PMPCBO75439 489 aa14.02□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 JCHAINP01591 159 aa14.02□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 DARSP14868 501 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 ETFBP38117 255 aa14.02□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 GLRBP48167 497 aa14.02□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 SYPL2Q5VXT5 272 aa14.02□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC30A9Q6PML9 568 aa14.02□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 MPP5Q8N3R9 675 aa14.02□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 ADAM7Q9H2U9 754 aa14.02□□□□□ -0.16
RABGEF1-210ENST00000437078 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa14.02□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 MYBPHLA2RUH7 354 aa14.02□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 ERVK-10P10266 1014 aa14.02□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 ATICP31939 592 aa14.02□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 TAF12Q16514 161 aa14.02□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa14.02□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 IPMKQ8NFU5 416 aa14.02□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms