RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FBXO4Q9UKT5 387 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TDGF1P13385 188 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TAF5Q15542 800 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ANO4Q32M45 955 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TAF3Q5VWG9 929 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DENND1CQ8IV53 801 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PHTF2Q8N3S3 785 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NAT16Q8N8M0 369 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EPS8L1Q8TE68 723 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PLD4Q96BZ4 506 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 K7EQS6 105 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SART1O43290 800 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RNF40O75150 1001 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GFPT2O94808 682 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NCAM1P13591 858 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PTPN20Q4JDL3 420 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TPGS1Q6ZTW0 290 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LUZP1Q86V48 1076 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NEK11Q8NG66 645 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GOLGA1Q92805 767 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EXOC4Q96A65 974 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DCLK3Q9C098 648 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MARK1Q9P0L2 795 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF510Q9Y2H8 683 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MYOFQ9NZM1 2061 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ERBB2P04626 1255 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HOXC13P31276 330 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SOX5P35711 763 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCR3P51677 355 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF528Q3MIS6 628 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SYPL2Q5VXT5 272 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC20A1Q8WUM9 679 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM149B1Q96BN6 582 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PNKPQ96T60 521 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRIM24O15164 1050 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TULP3O75386 442 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IGLV3-27P01718 113 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MMEP08473 750 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NBL1P41271 181 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CXCL12P48061 93 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FBXO43Q4G163 708 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BEND5Q7L4P6 421 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NELL1Q92832 810 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BBS2Q9BXC9 721 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 A0A0A0MRY4 1105 aa26.06■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM170AA1A519 330 aa26.06■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KAT7O95251 611 aa26.06■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TYRP14679 529 aa26.06■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KDSRQ06136 332 aa26.06■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa26.06■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM217AQ8IXS0 508 aa26.06■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM35BQ8NCS4 154 aa26.06■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NOX5Q96PH1 765 aa26.06■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPAG5Q96R06 1193 aa26.06■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 R4GN57 208 aa26.06■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 A0A1B0GTH6 734 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 K7ESF4 209 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CACNG3O60359 315 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CHRNB2P17787 502 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 STAT1P42224 750 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HARS2P49590 506 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FYB2Q5VWT5 728 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OLFML1Q6UWY5 402 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ADAM32Q8TC27 787 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BHMTQ93088 406 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PDCL3Q9H2J4 239 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 POPDC2Q9HBU9 364 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ARHGEF4Q9NR80 690 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 WDR35Q9P2L0 1181 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 STOML2Q9UJZ1 356 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CEP83Q9Y592 693 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 USP34Q70CQ2 3546 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PENKP01210 267 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CHKAP35790 457 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GRIA2P42262 883 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TAC4Q86UU9 113 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CPXM2Q8N436 756 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PLK2Q9NYY3 685 aa26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms