RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418674.1

PTPRC-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 462 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-207ENST00000418674 SERTAD3Q9UJW9 196 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 ANAPC4Q9UJX5 808 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 GJD2Q9UKL4 321 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 SNX14Q9Y5W7 946 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 COL15A1P39059 1388 aa3.35□□□□□ -1.87
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PTPRC-207ENST00000418674 CGB1A6NKQ9 187 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 J3KTA2 159 aa3.34□□□□□ -1.87
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PTPRC-207ENST00000418674 DNPH1O43598 174 aa3.34□□□□□ -1.87
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PTPRC-207ENST00000418674 RASGRP3Q8IV61 690 aa3.34□□□□□ -1.87
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PTPRC-207ENST00000418674 HERC6Q8IVU3 1022 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 IZUMO1Q8IYV9 350 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 NRSN1Q8IZ57 195 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 SUN3Q8TAQ9 357 aa3.33□□□□□ -1.88
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