RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377526.3

AUP1-201, Transcript of AUP1, lipid droplet regulating VLDL assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AUP1, Length 1,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1-201ENST00000377526 CKMP06732 381 aa20.36■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 PSMA2P25787 234 aa20.36■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 NOP2P46087 812 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 HADHBP55084 474 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 ATP11AP98196 1134 aa20.36■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 CDO1Q16878 200 aa20.36■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 LEXMQ3ZCV2 418 aa20.36■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 CPNE8Q86YQ8 564 aa20.36■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 CNPY3Q9BT09 278 aa20.36■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 NACA2Q9H009 215 aa20.36■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 MARCH2Q9P0N8 246 aa20.36■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 DNMT3LQ9UJW3 386 aa20.36■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa20.36■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 MACROD2A1Z1Q3 448 aa20.35■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 M0QYT0 321 aa20.35■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 IRAK2O43187 625 aa20.35■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 PFKLP17858 780 aa20.35■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 ZXDBP98169 803 aa20.35■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 TFF2Q03403 129 aa20.35■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 CMTM8Q8IZV2 173 aa20.35■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 TSGA10Q9BZW7 698 aa20.35■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 FAM204AQ9H8W3 233 aa20.35■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 RRN3Q9NYV6 651 aa20.35■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa20.35■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 SOBPA7XYQ1 873 aa20.35■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 MYO1FO00160 1098 aa20.35■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 PRAMEF12O95522 483 aa20.35■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 SLC7A9P82251 487 aa20.35■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa20.35■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa20.35■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 FAM172AQ8WUF8 416 aa20.35■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 GKN1Q9NS71 199 aa20.35■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 PIGVQ9NUD9 493 aa20.35■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 DDIT4Q9NX09 232 aa20.35■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 SMPD4Q9NXE4 827 aa20.35■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 COX16Q9P0S2 106 aa20.35■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 CDH7Q9ULB5 785 aa20.35■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 GUCA1BQ9UMX6 200 aa20.35■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 CPQQ9Y646 472 aa20.35■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 SLC12A8A0AV02 714 aa20.34■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 ZSCAN12O43309 604 aa20.34■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 KRT86O43790 486 aa20.34■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 ENDOD1O94919 500 aa20.34■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 MOCS3O95396 460 aa20.34■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 HDAC4P56524 1084 aa20.34■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 NME3Q13232 169 aa20.34■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 MESDQ14696 234 aa20.34■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 TPCN2Q8NHX9 752 aa20.34■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa20.34■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 SERPINB11Q96P15 392 aa20.34■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 GOLPH3Q9H4A6 298 aa20.34■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 GDE1Q9NZC3 331 aa20.34■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 IP6K2Q9UHH9 426 aa20.34■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 ZMYM5Q9UJ78 669 aa20.34■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 CCL26Q9Y258 94 aa20.34■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa20.33■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 PROSCO94903 275 aa20.33■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 HMBSP08397 361 aa20.33■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 AVPR1AP37288 418 aa20.33■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 DEUP1Q05D60 604 aa20.33■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa20.33■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 STRADAQ7RTN6 431 aa20.33■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 NIPA2Q8N8Q9 360 aa20.33■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 KIAA1524Q8TCG1 905 aa20.33■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 WBP2Q969T9 261 aa20.33■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa20.33■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa20.33■□□□□ 0.85
AUP1-201ENST00000377526 SP100P23497 879 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
AUP1-201ENST00000377526 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
AUP1-201ENST00000377526 RDXP35241 583 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
AUP1-201ENST00000377526 KCNQ1P51787 676 aa20.32■□□□□ 0.84
AUP1-201ENST00000377526 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
AUP1-201ENST00000377526 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
AUP1-201ENST00000377526 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
AUP1-201ENST00000377526 FAM78AQ5JUQ0 283 aa20.32■□□□□ 0.84
AUP1-201ENST00000377526 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
AUP1-201ENST00000377526 RIN3Q8TB24 985 aa20.32■□□□□ 0.84
AUP1-201ENST00000377526 SLC39A13Q96H72 371 aa20.32■□□□□ 0.84
AUP1-201ENST00000377526 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
AUP1-201ENST00000377526 ASB16Q96NS5 453 aa20.32■□□□□ 0.84
AUP1-201ENST00000377526 TLR6Q9Y2C9 796 aa20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms