RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 EPCAMP16422 314 aa18.49■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 C10orf120Q5SQS8 335 aa18.49■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 ERMARDQ5T6L9 678 aa18.49■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 CCDC149Q6ZUS6 474 aa18.49■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 BEND5Q7L4P6 421 aa18.49■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 KLHL7Q8IXQ5 586 aa18.49■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 SLC22A17Q8WUG5 538 aa18.49■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 OSBPL8Q9BZF1 889 aa18.49■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 ANLNQ9NQW6 1124 aa18.49■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP18.49■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 RASAL2Q9UJF2 1139 aa18.49■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 MAFFQ9ULX9 164 aa18.49■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 CCL16O15467 120 aa18.49■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 IRAK2O43187 625 aa18.49■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 CDKN2BP42772 138 aa18.49■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 DYNLT1P63172 113 aa18.49■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 ADCY2Q08462 1091 aa18.49■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 BOLA3Q53S33 107 aa18.49■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 CHRDL2Q6WN34 429 aa18.49■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP18.49■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 MIB1Q86YT6 1006 aa18.49■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa18.49■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 TEKT4Q8WW24 435 aa18.49■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 TSC1Q92574 1164 aa18.49■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 CEP295NLQ96MC4 621 aa18.49■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 PCDH18Q9HCL0 1135 aa18.49■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 MAN1C1Q9NR34 630 aa18.49■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 FZD10Q9ULW2 581 aa18.49■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa18.48■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 IGLV3-25P01717 112 aa18.48■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa18.48■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 GBP1P32455 592 aa18.48■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 GGCXP38435 758 aa18.48■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 CETN2P41208 172 aa18.48■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 HS6ST3Q8IZP7 471 aa18.48■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 PSMG2Q969U7 264 aa18.48■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 FAM118BQ9BPY3 351 aa18.48■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 CLIC5Q9NZA1 410 aa18.48■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 SNX10Q9Y5X0 201 aa18.48■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 I6L893 689 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 TLR5O60602 858 aa18.47■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 RFPL2O75678 378 aa18.47■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 F9P00740 461 aa18.47■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 HMBSP08397 361 aa18.47■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 BMP8BP34820 402 aa18.47■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 CXCR3P49682 368 aa18.47■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 PSEN1P49768 467 aa18.47■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 ARSEP51690 589 aa18.47■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 RBM10P98175 930 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 DPYSL3Q14195 570 aa18.47■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 TFDP3Q5H9I0 405 aa18.47■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 PPM1LQ5SGD2 360 aa18.47■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 MSANTD2Q6P1R3 559 aa18.47■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 ITIH5Q86UX2 942 aa18.47■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 RFX6Q8HWS3 928 aa18.47■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 PDZD8Q8NEN9 1154 aa18.47■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 HAUS1Q96CS2 278 aa18.47■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 EPC1Q9H2F5 836 aa18.47■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa18.47■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa18.47■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 UQCRHLA0A096LP55 91 aa18.46■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 ZNF840PA6NDX5 716 aa18.46■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 UQCRHP07919 91 aa18.46■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 L1CAMP32004 1257 aa18.46■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 EFHC2Q5JST6 749 aa18.46■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 ZNF697Q5TEC3 545 aa18.46■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 ATG4AQ8WYN0 398 aa18.46■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 TIFAQ96CG3 184 aa18.46■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 MYRFLQ96LU7 910 aa18.46■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 SERPINB11Q96P15 392 aa18.46■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 KRT12Q99456 494 aa18.46■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 TKTL2Q9H0I9 626 aa18.46■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 WDCPQ9H6R7 721 aa18.46■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 MARCH2Q9P0N8 246 aa18.46■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 EFCAB8A8MWE9 144 aa18.46■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 RHOXF2BP0C7M4 288 aa18.46■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 ADRA1BP35368 520 aa18.46■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa18.46■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 PRELID2Q8N945 189 aa18.46■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 C1orf54Q8WWF1 131 aa18.46■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 RHOXF2Q9BQY4 288 aa18.46■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 NACA2Q9H009 215 aa18.46■□□□□ 0.55
LTV1-201ENST00000367576 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms