RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 RAMP2O60895 175 aa20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 HMGCRP04035 888 aa20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 SCNN1BP51168 640 aa20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 BMPR2Q13873 1038 aa20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 NT5DC3Q86UY8 548 aa20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM69Q86WT6 500 aa20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 HERC6Q8IVU3 1022 aa20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM48Q8IWZ4 208 aa20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 EDEM1Q92611 657 aa20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 IMPAD1Q9NX62 359 aa20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 UBP1Q9NZI7 540 aa20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 RIPK2O43353 540 aa20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 KRT8P05787 483 aa20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 PEX5P50542 639 aa20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 NCALDP61601 193 aa20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 MFSD7Q6UXD7 560 aa20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 SCUBE1Q8IWY4 988 aa20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 TRHDEQ9UKU6 1024 aa20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa20.83■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 ALDH1A2O94788 518 aa20.83■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 CNTN2Q02246 1040 aa20.83■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 CNTN1Q12860 1018 aa20.83■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 KCNK18Q7Z418 384 aa20.83■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 HTR3CQ8WXA8 447 aa20.83■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 MRIQ9BWK5 157 aa20.83■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 POMCP01189 267 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 RARAP10276 462 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 CD151P48509 253 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 BLVRAP53004 296 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 SLC22A9Q8IVM8 553 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 CAAP1Q9H8G2 361 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 RAB21Q9UL25 225 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 AKR1A1P14550 325 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 AKAP5P24588 427 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 SMARCD1Q96GM5 515 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM150BA6NC51 233 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 PPATQ06203 517 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 RASA2Q15283 850 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 GALNTL6Q49A17 601 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 ADORA2AP29274 412 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 SCTRP47872 440 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 C11orf96Q7Z7L8 435 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 TBC1D23Q9NUY8 699 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 MST1RQ04912 1400 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 TBX4P57082 545 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 TMC7Q7Z402 723 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 FAM136AQ96C01 138 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 SERPINB11Q96P15 392 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 SH3GL1Q99961 368 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 DCLRE1BQ9H816 532 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 DPP7Q9UHL4 492 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 TAGLN3Q9UI15 199 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 GAKO14976 1311 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 LACTBL1A8MY62 500 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 MICAL2O94851 1124 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 MLNP12872 115 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 BGNP21810 368 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 ITGA9Q13797 1035 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 CDH8P55286 799 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 POU6F1Q14863 301 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 FUT11Q495W5 492 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 C1orf186Q6ZWK4 172 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 ITIH5Q86UX2 942 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 MPP6Q9NZW5 540 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 NFYCQ13952 458 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 SLC30A9Q6PML9 568 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 TMC3Q7Z5M5 1100 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM51Q9NW97 253 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 USP1O94782 785 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 ERVK-9P63128 1117 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 WDR59Q6PJI9 974 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 TLK2Q86UE8 772 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 VSIG10LQ86VR7 867 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 ELOVL4Q9GZR5 314 aa20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms