RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362861.1

RNU6-1079P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1079, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1079P, Length 110 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GPR15P49685 360 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PGFP49763 221 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MINDY4Q4G0A6 757 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CREB3L3Q68CJ9 461 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TMEM65Q6PI78 240 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FJX1Q86VR8 437 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GLB1L2Q8IW92 636 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PCDH19Q8TAB3 1148 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KRT35Q92764 455 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LRR1Q96L50 414 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LYSTQ99698 3801 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FSD1Q9BTV5 496 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF700Q9H0M5 742 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ISCUQ9H1K1 167 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TASP1Q9H6P5 420 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 UBTD1Q9HAC8 227 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SERHLQ9NQF3 203 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TMEM160Q9NX00 188 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OCIAD1Q9NX40 245 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IKZF3Q9UKT9 509 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MMACHCQ9Y4U1 282 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 COL6A6A6NMZ7 2263 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ABCA4P78363 2273 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 A0A1W2PQU0 124 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLC12A8A0AV02 714 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MAGEA13PA6NCF6 341 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LRCOL1A6NCL2 159 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BECN2A8MW95 431 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EYA2O00167 538 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PPM1DO15297 605 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 USP12O75317 370 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PCDH8O95206 1070 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PLAUP00749 431 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CYP1A2P05177 515 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CD5P06127 495 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PDHA1P08559 390 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF84P51523 738 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PLCB2Q00722 1185 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PIGFQ07326 219 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NCAPHQ15003 741 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FNBP1LQ5T0N5 605 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SEL1L3Q68CR1 1132 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF613Q6PF04 617 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PARM1Q6UWI2 310 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SEM1Q6ZVN7 128 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TUBA1AQ71U36 451 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 STAMQ92783 540 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C18orf12Q96KH6 178 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C2orf48Q96LS8 159 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MGME1Q9BQP7 344 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IER2Q9BTL4 223 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GAREM1Q9H706 876 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LOXL2Q9Y4K0 774 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TPRP12270 2363 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TLN2Q9Y4G6 2542 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MTORP42345 2549 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 A0A1W2PS18 150 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EPM2AB3EWF7 344 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 APOL3O95236 402 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LCATP04180 440 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FESP07332 822 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CTSHP09668 335 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PATE4P0C8F1 98 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HGFP14210 728 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FPR3P25089 353 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ITGB8P26012 769 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GRIA2P42262 883 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DNM2P50570 870 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLC12A2P55011 1212 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NDPQ00604 133 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM110CQ1W6H9 321 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FOXB2Q5VYV0 432 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 VSTM1Q6UX27 236 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ANKS3Q6ZW76 656 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM178BQ8IXR5 827 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP-0.76□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms