RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360046.9

HOXA4-201, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA4, Length 1,747 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-201ENST00000360046 BOLA3Q53S33 107 aa22.77■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 CCDC185Q8N715 623 aa22.77■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 RNF34Q969K3 372 aa22.77■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 CARD6Q9BX69 1037 aa22.77■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 CCSER2Q9H7U1 834 aa22.77■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa22.77■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF840PA6NDX5 716 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 MSI1O43347 362 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 TLR5O60602 858 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 ZMYND10O75800 440 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 FGGP02679 453 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 LLGL1Q15334 1064 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 MSANTD2Q6P1R3 559 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 RCOR2Q8IZ40 523 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 KCTD6Q8NC69 237 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 RAPGEF5Q92565 580 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 SERPINB11Q96P15 392 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 RNF14Q9UBS8 474 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 DPP7Q9UHL4 492 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 MDM4O15151 490 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 IRAK2O43187 625 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 RFPL2O75678 378 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 TBX18O95935 607 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 IGLV3-25P01717 112 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 ERMARDQ5T6L9 678 aa22.75■■□□□ 1.23
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HOXA4-201ENST00000360046 RTL10Q7L3V2 364 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 RASGEF1CQ8N431 466 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 ACTRT1Q8TDG2 376 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 TEKT4Q8WW24 435 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 NACA2Q9H009 215 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
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HOXA4-201ENST00000360046 RASAL2Q9UJF2 1139 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa22.75■■□□□ 1.23
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HOXA4-201ENST00000360046 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.74■■□□□ 1.23
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HOXA4-201ENST00000360046 PPP3CCP48454 512 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 GRIN2CQ14957 1233 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF697Q5TEC3 545 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 TADA2BQ86TJ2 420 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 MIB1Q86YT6 1006 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 CEP112Q8N8E3 955 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 MNS1Q8NEH6 495 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
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HOXA4-201ENST00000360046 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
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HOXA4-201ENST00000360046 LONRF2Q1L5Z9 754 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 HECTD3Q5T447 861 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 SNX30Q5VWJ9 437 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 MFSD7Q6UXD7 560 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 HS6ST3Q8IZP7 471 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 HDAC7Q8WUI4 952 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 CORO1BQ9BR76 489 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 CALN1Q9BXU9 219 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
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HOXA4-201ENST00000360046 ASAH2Q9NR71 780 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 MARCH2Q9P0N8 246 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 OBSL1O75147 1896 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa22.73■■□□□ 1.23
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HOXA4-201ENST00000360046 GABRR2P28476 465 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 ARL13BQ3SXY8 428 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 FAM161BQ96MY7 647 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 FZD10Q9ULW2 581 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 TMEM265A0A087WTH1 108 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 F11P03951 625 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 CD48P09326 243 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 HOXA9P31269 272 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 CLUL1Q15846 466 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 CA9Q16790 459 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 TCEAL5Q5H9L2 206 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 EFHC2Q5JST6 749 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 TMEM150AQ86TG1 271 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 HEMGNQ9BXL5 484 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXA4-201ENST00000360046 OSBPL8Q9BZF1 889 aa22.72■■□□□ 1.23
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