RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356435.9

PTPRD-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 9,472 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-202ENST00000356435 CHI3L2Q15782 390 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRD-202ENST00000356435 SMARCD1Q96GM5 515 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRD-202ENST00000356435 CCT8L2Q96SF2 557 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRD-202ENST00000356435 SLC39A8Q9C0K1 460 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-202ENST00000356435 CPA4Q9UI42 421 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRD-202ENST00000356435 TRAF7Q6Q0C0 670 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRD-202ENST00000356435 APBB2Q92870 758 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRD-202ENST00000356435 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
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PTPRD-202ENST00000356435 NT5MQ9NPB1 228 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRD-202ENST00000356435 OR6A2O95222 327 aa5.68□□□□□ -1.5
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