RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 GDE1Q9NZC3 331 aa28.97■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa28.97■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa28.96■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 F9P00740 461 aa28.96■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 NNTQ13423 1086 aa28.96■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 STRADAQ7RTN6 431 aa28.96■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 MIB1Q86YT6 1006 aa28.96■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 NPAS3Q8IXF0 933 aa28.96■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 FGF13Q92913 245 aa28.96■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 CYP2S1Q96SQ9 504 aa28.96■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 DDIT4Q9NX09 232 aa28.96■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 DENND4AQ7Z401 1863 aa28.96■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 MDM4O15151 490 aa28.96■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 RNF8O76064 485 aa28.96■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 IGLV3-25P01717 112 aa28.96■■■□□ 2.23
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GIPC1-201ENST00000345425 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 SLC7A9P82251 487 aa28.96■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa28.96■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 CDO1Q16878 200 aa28.96■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 REXO1L1PQ8IX06 675 aa28.96■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 NIPA2Q8N8Q9 360 aa28.96■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 ADAM32Q8TC27 787 aa28.96■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 SLC22A12Q96S37 553 aa28.96■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 NCAPGQ9BPX3 1015 aa28.96■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa28.96■■■□□ 2.23
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GIPC1-201ENST00000345425 LEXMQ3ZCV2 418 aa28.95■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 TPCN2Q8NHX9 752 aa28.95■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 KIAA1524Q8TCG1 905 aa28.95■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 FAM172AQ8WUF8 416 aa28.95■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 CDH7Q9ULB5 785 aa28.95■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 IRAK2O43187 625 aa28.94■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 PROSCO94903 275 aa28.94■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 RDXP35241 583 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 COG7P83436 770 aa28.94■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 DEUP1Q05D60 604 aa28.94■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 NME3Q13232 169 aa28.94■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP28.94■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 BNIPLQ7Z465 357 aa28.94■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 KCND1Q9NSA2 647 aa28.94■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 TLR6Q9Y2C9 796 aa28.94■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa28.94■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa28.93■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 SLC12A8A0AV02 714 aa28.93■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 GRXCR2A6NFK2 248 aa28.93■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 ENDOD1O94919 500 aa28.93■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 WEE1P30291 646 aa28.93■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 MAN1A1P33908 653 aa28.93■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 COX16Q9P0S2 106 aa28.93■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 MSI1O43347 362 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
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GIPC1-201ENST00000345425 ADAM33Q9BZ11 813 aa28.93■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa28.93■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 CPQQ9Y646 472 aa28.93■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 MOCS3O95396 460 aa28.92■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa28.92■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 C11orf63Q6NUN7 778 aa28.92■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
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GIPC1-201ENST00000345425 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
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GIPC1-201ENST00000345425 TBX4P57082 545 aa28.91■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 DAAM2Q86T65 1068 aa28.91■■■□□ 2.22
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GIPC1-201ENST00000345425 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
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GIPC1-201ENST00000345425 OTOP3Q7RTS5 596 aa28.9■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 SYCE1Q8N0S2 351 aa28.9■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 RNF34Q969K3 372 aa28.9■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 PLD4Q96BZ4 506 aa28.9■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa28.9■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 USTQ9Y2C2 406 aa28.9■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 HELZP42694 1942 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 CCR1P32246 355 aa28.9■■■□□ 2.22
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