RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337004.8

PTDSS1-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS1, Length 2,366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-201ENST00000337004 KRT36O76013 467 aa22.25■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 METTL18O95568 372 aa22.25■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF333Q96JL9 665 aa22.25■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 PCMTD2Q9NV79 361 aa22.25■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 NMRK1Q9NWW6 199 aa22.25■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 HESX1Q9UBX0 185 aa22.25■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 A6NJR5 290 aa22.24■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 CAPN14A8MX76 684 aa22.24■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 CAPN9O14815 690 aa22.24■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 MAGEC1O60732 1142 aa22.24■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 NR2C2P49116 596 aa22.24■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 PKDCCQ504Y2 493 aa22.24■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 MROH9Q5TGP6 573 aa22.24■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa22.24■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 LRRN4Q8WUT4 740 aa22.24■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 KIF12Q96FN5 646 aa22.24■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 MMP19Q99542 508 aa22.24■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa22.24■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 CYB561D2O14569 222 aa22.24■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 RAP1GDS1P52306 607 aa22.24■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 HDAC4P56524 1084 aa22.24■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 SARNPP82979 210 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 TEX44Q53QW1 395 aa22.24■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 TTC30AQ86WT1 665 aa22.24■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa22.24■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 WDR60Q8WVS4 1066 aa22.24■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa22.23■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 ENO1P06733 434 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 BPGMP07738 259 aa22.23■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 CNTFP26441 200 aa22.23■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 AQP5P55064 265 aa22.23■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 KLC1Q07866 573 aa22.23■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF534Q76KX8 674 aa22.23■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 ACOT1Q86TX2 421 aa22.23■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC35F5Q8WV83 523 aa22.23■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 ARHGEF4Q9NR80 690 aa22.23■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa22.23■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 H3BRJ5 948 aa22.23■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 STX3Q13277 289 aa22.23■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 TBCCQ15814 346 aa22.23■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 DPYSL2Q16555 572 aa22.23■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 TIFABQ6ZNK6 161 aa22.23■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 CYS1Q717R9 158 aa22.23■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 ARCQ7LC44 396 aa22.23■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 PPFIBP2Q8ND30 876 aa22.23■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 STKLD1Q8NE28 680 aa22.23■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 SNNO75324 88 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 ZBTB7AO95365 584 aa22.22■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 PDHA1P08559 390 aa22.22■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 KITP10721 976 aa22.22■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 L1CAMP32004 1257 aa22.22■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 BAG6P46379 1132 aa22.22■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 CPA2P48052 419 aa22.22■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 GBE1Q04446 702 aa22.22■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 MPP5Q8N3R9 675 aa22.22■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 PDGFCQ9NRA1 345 aa22.22■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 TAGLN3Q9UI15 199 aa22.22■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 HMX2A2RU54 273 aa22.21■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa22.21■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 IRF6O14896 467 aa22.21■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 TBX10O75333 385 aa22.21■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 VTNP04004 478 aa22.21■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 SKIP12755 728 aa22.21■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa22.21■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 TREML1Q86YW5 311 aa22.21■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 RILPQ96NA2 401 aa22.21■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 FAM49BQ9NUQ9 324 aa22.21■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 THAP1Q9NVV9 213 aa22.21■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 SNX9Q9Y5X1 595 aa22.21■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 ANK1P16157 1881 aa22.21■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 F8W8V4 182 aa22.21■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 PTPN9P43378 593 aa22.21■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 SEMA5AQ13591 1074 aa22.21■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 CES4AQ5XG92 561 aa22.21■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 KCNT2Q6UVM3 1135 aa22.21■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 LINC01465Q8N7H1 131 aa22.21■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa22.21■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 NLRP7Q8WX94 980 aa22.21■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 FAM161BQ96MY7 647 aa22.21■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 MOCS1Q9NZB8 636 aa22.21■■□□□ 1.15
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