RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 MSI1O43347 362 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 CACNG3O60359 315 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 LMNAP02545 664 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 LTFP02788 710 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 APODP05090 189 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 UCHL3P15374 230 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF18P17022 549 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 HOXA6P31267 233 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACADSBP45954 432 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 FNTBP49356 437 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 NRLP54845 237 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 SEC13P55735 322 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTK2Q05397 1052 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAPGEF1Q13905 1077 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 TPGS1Q6ZTW0 290 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC47A2Q86VL8 602 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 DENND1CQ8IV53 801 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACDQ96AP0 544 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 BBS2Q9BXC9 721 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A0A0MRY4 1105 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 E5RJQ4 531 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM24O15164 1050 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 FYNP06241 537 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 TYRP14679 529 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 GRIA2P42262 883 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLK7P49862 253 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 COPB1P53618 953 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 SYT13Q7L8C5 426 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM110Q86TL2 294 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 PASD1Q8IV76 773 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCUBE3Q8IX30 993 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 WDTC1Q8N5D0 677 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 SUMF1Q8NBK3 374 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC26Q8TAB7 109 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 GANQ9H2C0 597 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 EPC1Q9H2F5 836 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLCB1Q9NQ66 1216 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 WDR35Q9P2L0 1181 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 DEC1Q9P2X7 70 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 TJP2Q9UDY2 1190 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC8A2Q9UPR5 921 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 EML5Q05BV3 1969 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 SART1O43290 800 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 DMC1Q14565 340 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANO6Q4KMQ2 910 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 C2orf27AQ580R0 203 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 LONP2Q86WA8 852 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM217AQ8IXS0 508 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 AOPEPQ8N6M6 819 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 TERB1Q8NA31 727 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 GOLGA1Q92805 767 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 BHMTQ93088 406 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 F8VZ95 297 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 PENKP01210 267 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGLV3-27P01718 113 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 TPM2P07951 284 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 FKBP15Q5T1M5 1219 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 FYB2Q5VWT5 728 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 GRAMD4Q6IC98 578 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 CPXM2Q8N436 756 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 HHIPQ96QV1 700 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 CPXM1Q96SM3 734 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 LHX5Q9H2C1 402 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLK2Q9NYY3 685 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 SIK3Q9Y2K2 1263 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 LGALS16A8MUM7 142 aa20.4■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 EPHB6O15197 1021 aa20.4■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHKAP35790 457 aa20.4■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 TNFRSF4P43489 277 aa20.4■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 PXNP49023 591 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 EMC10Q5UCC4 262 aa20.4■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 WDR5BQ86VZ2 330 aa20.4■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALLCQ8N6M5 410 aa20.4■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa20.4■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM149B1Q96BN6 582 aa20.4■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 STK33Q9BYT3 514 aa20.4■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 STOML2Q9UJZ1 356 aa20.4■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 MMP17Q9ULZ9 603 aa20.4■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa20.4■□□□□ 0.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF292O60281 2723 aa20.39■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBC1D3BA6NDS4 549 aa20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms