RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAB6CQ53S08 254 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 BNIPLQ7Z465 357 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM131BQ86XD5 332 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMC8Q8IU68 726 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 TUBB2BQ9BVA1 445 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAB6CQ9H0N0 254 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATXN3LQ9H3M9 355 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 IL21Q9HBE4 155 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 PIGVQ9NUD9 493 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 IRAK2O43187 625 aa28.54■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP28.54■■■□□ 2.167e-25■□□□□ 11
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PEX5P50542 639 aa28.54■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 RBM10P98175 930 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 HYAL1Q12794 435 aa28.54■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 SMTNL2Q2TAL5 461 aa28.54■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARL13BQ3SXY8 428 aa28.54■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 KATNAL2Q8IYT4 538 aa28.54■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 HSPH1Q92598 858 aa28.54■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 WDCPQ9H6R7 721 aa28.54■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRPC7Q9HCX4 862 aa28.54■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa28.54■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 TADA3O75528 432 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 TBX18O95935 607 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGLV3-25P01717 112 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 KRT1P04264 644 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 IL1R2P27930 398 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 GRIN2CQ14957 1233 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 MIB1Q86YT6 1006 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 EFHBQ8N7U6 833 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 TEKT4Q8WW24 435 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 ALG3Q92685 438 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 LRRC3Q9BY71 257 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 CARD9Q9H257 536 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 CXCR3P49682 368 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 AMPD2Q01433 879 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCNC3Q14003 757 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCNT1Q5JUK3 1230 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 ERMARDQ5T6L9 678 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 SEL1L2Q5TEA6 688 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 KLHDC10Q6PID8 442 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM150AQ86TG1 271 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 VN1R2Q8NFZ6 395 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 PEBP4Q96S96 227 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 TLR6Q9Y2C9 796 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 CES2O00748 559 aa28.52■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 MDM4O15151 490 aa28.52■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 MSI1O43347 362 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
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CTDNEP1-201ENST00000318988 RARAP10276 462 aa28.52■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC2A3P11169 496 aa28.52■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCR1P32246 355 aa28.52■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 AIF1P55008 147 aa28.52■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 TBX4P57082 545 aa28.52■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 NNTQ13423 1086 aa28.52■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa28.52■■■□□ 2.16
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC50Q8IVM0 306 aa28.52■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 RCOR2Q8IZ40 523 aa28.52■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCTD6Q8NC69 237 aa28.52■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 EXD1Q8NHP7 514 aa28.52■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1W2PRU2 124 aa28.51■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC12A8A0AV02 714 aa28.51■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 COCHO43405 550 aa28.51■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 CEP104O60308 925 aa28.51■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 EPHA5P54756 1037 aa28.51■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa28.51■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa28.51■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 BRMS1LQ5PSV4 323 aa28.51■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC181Q5TID7 509 aa28.51■■■□□ 2.15
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
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CTDNEP1-201ENST00000318988 LRRD1A4D1F6 860 aa28.5■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 C2orf78A6NCI8 922 aa28.5■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF197O14709 1029 aa28.5■■■□□ 2.15
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CYP4F8P98187 520 aa28.5■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 KRT81Q14533 505 aa28.5■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 EFHC2Q5JST6 749 aa28.5■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa28.5■■■□□ 2.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
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