RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317243.9

ZNF554-201, Transcript of zinc finger protein 554, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF554, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554-201ENST00000317243 NME7Q9Y5B8 376 aa20.11■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 PFDN1O60925 122 aa20.11■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 FAM163BP0C2L3 166 aa20.11■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 RAPH1Q70E73 1250 aa20.11■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 SATL1Q86VE3 508 aa20.11■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 FAM111AQ96PZ2 611 aa20.11■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa20.11■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 TTC36A6NLP5 189 aa20.1■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 LPXNO60711 386 aa20.1■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 ENO1P06733 434 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 VAV1P15498 845 aa20.1■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 OSBPP22059 807 aa20.1■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 EPHX2P34913 555 aa20.1■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 NDST1P52848 882 aa20.1■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 ARL4CP56559 192 aa20.1■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 DPY19L2Q6NUT2 758 aa20.1■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 UNC45BQ8IWX7 931 aa20.1■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 ATP11CQ8NB49 1132 aa20.1■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 HPDLQ96IR7 371 aa20.1■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 OLFM3Q96PB7 478 aa20.1■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 C16orf70Q9BSU1 422 aa20.1■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 CALN1Q9BXU9 219 aa20.1■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 FAM49BQ9NUQ9 324 aa20.1■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 GJD2Q9UKL4 321 aa20.1■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 CILPO75339 1184 aa20.1■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 MYL2P10916 166 aa20.1■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 BGNP21810 368 aa20.1■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 CRABP2P29373 138 aa20.1■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 MIPP30301 263 aa20.1■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP20.1■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa20.1■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 ARHGAP24Q8N264 748 aa20.1■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 PPP2R3CQ969Q6 453 aa20.1■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 MPP4Q96JB8 637 aa20.1■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 THTPAQ9BU02 230 aa20.1■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 PCDH9Q9HC56 1237 aa20.1■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 CHMP2BQ9UQN3 213 aa20.1■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 DOCK3Q8IZD9 2030 aa20.09■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 DNAJC6O75061 913 aa20.09■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 ASLP04424 464 aa20.09■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 RAP1GDS1P52306 607 aa20.09■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 RASA2Q15283 850 aa20.09■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 CCDC142Q17RM4 750 aa20.09■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 MARCH8Q5T0T0 291 aa20.09■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 ADGRD1Q6QNK2 874 aa20.09■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 BANPQ8N9N5 519 aa20.09■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 STKLD1Q8NE28 680 aa20.09■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 CCDC110Q8TBZ0 833 aa20.09■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 CPT1BQ92523 772 aa20.09■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 PHACTR1Q9C0D0 580 aa20.09■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 TMEM165Q9HC07 324 aa20.09■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 HSFX1Q9UBD0 423 aa20.09■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa20.09■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 CITO14578 2027 aa20.09■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa20.09■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 E5RJQ4 531 aa20.09■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 MT-ND3P03897 115 aa20.09■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 DLDP09622 509 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 KRT72Q14CN4 511 aa20.09■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 SCUBE1Q8IWY4 988 aa20.09■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 TMEM176AQ96HP8 235 aa20.09■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 SETD4Q9NVD3 440 aa20.09■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa20.08■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 ITGAVP06756 1048 aa20.08■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 GPD2P43304 727 aa20.08■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 PHKA2P46019 1235 aa20.08■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 AP2B1P63010 937 aa20.08■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 KDSRQ06136 332 aa20.08■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 OLFML2BQ68BL8 750 aa20.08■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 RASSF3Q86WH2 238 aa20.08■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 PDHXO00330 501 aa20.08■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 GAS2O43903 313 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 TSPAN1O60635 241 aa20.08■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 KDELR1P24390 212 aa20.08■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 BASP1P80723 227 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 C1orf146Q5VVC0 180 aa20.08■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 TREML1Q86YW5 311 aa20.08■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 PPIL6Q8IXY8 311 aa20.08■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 FAM71DQ8N9W8 422 aa20.08■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 SHKBP1Q8TBC3 707 aa20.08■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 RSAD2Q8WXG1 361 aa20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms