RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297316.4

SOX17-201, Transcript of SRY-box 17, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOX17, Length 2,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17-201ENST00000297316 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
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SOX17-201ENST00000297316 TMEM51Q9NW97 253 aa22.19■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 MARCH5Q9NX47 278 aa22.19■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 RBP3P10745 1247 aa22.19■■□□□ 1.14
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SOX17-201ENST00000297316 FAM171A1Q5VUB5 890 aa22.18■■□□□ 1.14
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SOX17-201ENST00000297316 NOS2P35228 1153 aa22.18■■□□□ 1.14
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SOX17-201ENST00000297316 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
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SOX17-201ENST00000297316 AP4E1Q9UPM8 1137 aa22.18■■□□□ 1.14
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SOX17-201ENST00000297316 MCF2LO15068 1137 aa22.17■■□□□ 1.14
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SOX17-201ENST00000297316 DESP17661 470 aa22.17■■□□□ 1.14
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SOX17-201ENST00000297316 NT5C3BQ969T7 300 aa22.17■■□□□ 1.14
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SOX17-201ENST00000297316 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa22.17■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 TBX21Q9UL17 535 aa22.17■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa22.17■■□□□ 1.14
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SOX17-201ENST00000297316 FBXO21O94952 628 aa22.17■■□□□ 1.14
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SOX17-201ENST00000297316 C6orf118Q5T5N4 469 aa22.17■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 SDHAF4Q5VUM1 108 aa22.17■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
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SOX17-201ENST00000297316 TOX2Q96NM4 488 aa22.17■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 PGLYRP2Q96PD5 576 aa22.17■■□□□ 1.14
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SOX17-201ENST00000297316 CAPN9O14815 690 aa22.16■■□□□ 1.14
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SOX17-201ENST00000297316 SLC7A14Q8TBB6 771 aa22.16■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 MDM1Q8TC05 714 aa22.16■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
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SOX17-201ENST00000297316 TMEM39AQ9NV64 488 aa22.16■■□□□ 1.14
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SOX17-201ENST00000297316 AMHP03971 560 aa22.15■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 GRIK1P39086 918 aa22.15■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 PGFP49763 221 aa22.15■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 ROR1Q01973 937 aa22.15■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 CCDC38Q502W7 563 aa22.15■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 SLC9A4Q6AI14 798 aa22.15■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 BNIPLQ7Z465 357 aa22.15■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 MAP7D3Q8IWC1 876 aa22.15■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa22.15■■□□□ 1.14
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