RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 MCUQ8NE86 351 aa24.83■■□□□ 1.57
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TRIM54-201ENST00000296098 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
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TRIM54-201ENST00000296098 POPDC2Q9HBU9 364 aa24.83■■□□□ 1.57
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TRIM54-201ENST00000296098 STARD13Q9Y3M8 1113 aa24.83■■□□□ 1.57
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TRIM54-201ENST00000296098 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
TRIM54-201ENST00000296098 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
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TRIM54-201ENST00000296098 PHTF1Q9UMS5 762 aa24.82■■□□□ 1.56
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TRIM54-201ENST00000296098 STAP1Q9ULZ2 295 aa24.81■■□□□ 1.56
TRIM54-201ENST00000296098 MEIS3P2A8K0S8 358 aa24.81■■□□□ 1.56
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TRIM54-201ENST00000296098 NOS2P35228 1153 aa24.81■■□□□ 1.56
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TRIM54-201ENST00000296098 ARHGEF4Q9NR80 690 aa24.8■■□□□ 1.56
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TRIM54-201ENST00000296098 ZNF534Q76KX8 674 aa24.79■■□□□ 1.56
TRIM54-201ENST00000296098 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
TRIM54-201ENST00000296098 SLC26A11Q86WA9 606 aa24.79■■□□□ 1.56
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