RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295767.9

CHCHD4-201, Transcript of coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CHCHD4, Length 1,603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4-201ENST00000295767 AVPR1AP37288 418 aa28.93■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 ATP11AP98196 1134 aa28.93■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 GDE1Q9NZC3 331 aa28.93■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 COL6A3P12111 3177 aa28.92■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 M0QYT0 321 aa28.92■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 CCP110O43303 1012 aa28.92■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 PSMA2P25787 234 aa28.92■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 SLC7A9P82251 487 aa28.92■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 CDO1Q16878 200 aa28.92■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 CNPY3Q9BT09 278 aa28.92■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 FAM204AQ9H8W3 233 aa28.92■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 SMPD4Q9NXE4 827 aa28.92■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 IRAK2O43187 625 aa28.91■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 ARHGAP25P42331 645 aa28.91■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 NOP2P46087 812 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 HADHBP55084 474 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa28.91■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 SERPINB11Q96P15 392 aa28.91■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 DDIT4Q9NX09 232 aa28.91■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 CPQQ9Y646 472 aa28.91■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa28.91■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 SLC12A8A0AV02 714 aa28.91■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 BUB1O43683 1085 aa28.91■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 PRAMEF12O95522 483 aa28.91■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 ZXDBP98169 803 aa28.91■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 RAB6CQ53S08 254 aa28.91■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 BNIPLQ7Z465 357 aa28.91■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 TSGA10Q9BZW7 698 aa28.91■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 RAB6CQ9H0N0 254 aa28.91■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 COX16Q9P0S2 106 aa28.91■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 MYO1FO00160 1098 aa28.9■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 SP100P23497 879 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 NME3Q13232 169 aa28.9■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 FAM78AQ5JUQ0 283 aa28.9■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 ZNF662Q6ZS27 426 aa28.9■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 FAM172AQ8WUF8 416 aa28.9■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 ASB16Q96NS5 453 aa28.9■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 LZTFL1Q9NQ48 299 aa28.9■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 GKN1Q9NS71 199 aa28.9■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 IP6K2Q9UHH9 426 aa28.9■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa28.9■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 CCL26Q9Y258 94 aa28.9■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 MACROD2A1Z1Q3 448 aa28.89■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 KRT86O43790 486 aa28.89■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 PIGVQ9NUD9 493 aa28.89■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 TDP1Q9NUW8 608 aa28.89■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 THEGQ9P2T0 379 aa28.89■■■□□ 2.22
CHCHD4-201ENST00000295767 ENDOD1O94919 500 aa28.88■■■□□ 2.21
CHCHD4-201ENST00000295767 HMBSP08397 361 aa28.88■■■□□ 2.21
CHCHD4-201ENST00000295767 LAMP2P13473 410 aa28.88■■■□□ 2.21
CHCHD4-201ENST00000295767 WEE1P30291 646 aa28.88■■■□□ 2.21
CHCHD4-201ENST00000295767 GBP1P32455 592 aa28.88■■■□□ 2.21
CHCHD4-201ENST00000295767 DEUP1Q05D60 604 aa28.88■■■□□ 2.21
CHCHD4-201ENST00000295767 NNTQ13423 1086 aa28.88■■■□□ 2.21
CHCHD4-201ENST00000295767 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
CHCHD4-201ENST00000295767 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
CHCHD4-201ENST00000295767 HS1BP3Q53T59 392 aa28.88■■■□□ 2.21
CHCHD4-201ENST00000295767 STRADAQ7RTN6 431 aa28.88■■■□□ 2.21
CHCHD4-201ENST00000295767 OTOP3Q7RTS5 596 aa28.88■■■□□ 2.21
CHCHD4-201ENST00000295767 GUCA1BQ9UMX6 200 aa28.88■■■□□ 2.21
CHCHD4-201ENST00000295767 TLR6Q9Y2C9 796 aa28.88■■■□□ 2.21
CHCHD4-201ENST00000295767 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
CHCHD4-201ENST00000295767 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa28.88■■■□□ 2.21
CHCHD4-201ENST00000295767 IRF1P10914 325 aa28.87■■■□□ 2.21
CHCHD4-201ENST00000295767 RDXP35241 583 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
CHCHD4-201ENST00000295767 HDAC4P56524 1084 aa28.87■■■□□ 2.21
CHCHD4-201ENST00000295767 COG7P83436 770 aa28.87■■■□□ 2.21
CHCHD4-201ENST00000295767 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
CHCHD4-201ENST00000295767 MESDQ14696 234 aa28.87■■■□□ 2.21
CHCHD4-201ENST00000295767 REXO1L1PQ8IX06 675 aa28.87■■■□□ 2.21
CHCHD4-201ENST00000295767 NIPA2Q8N8Q9 360 aa28.87■■■□□ 2.21
CHCHD4-201ENST00000295767 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa28.87■■■□□ 2.21
CHCHD4-201ENST00000295767 SMARCD2Q92925 531 aa28.87■■■□□ 2.21
CHCHD4-201ENST00000295767 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
CHCHD4-201ENST00000295767 USTQ9Y2C2 406 aa28.87■■■□□ 2.21
CHCHD4-201ENST00000295767 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
CHCHD4-201ENST00000295767 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa28.87■■■□□ 2.21
CHCHD4-201ENST00000295767 ZSCAN12O43309 604 aa28.87■■■□□ 2.21
CHCHD4-201ENST00000295767 IGLV3-27P01718 113 aa28.87■■■□□ 2.21
CHCHD4-201ENST00000295767 IL9P15248 144 aa28.87■■■□□ 2.21
CHCHD4-201ENST00000295767 DESP17661 470 aa28.87■■■□□ 2.21
CHCHD4-201ENST00000295767 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
CHCHD4-201ENST00000295767 TBX4P57082 545 aa28.87■■■□□ 2.21
CHCHD4-201ENST00000295767 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa28.87■■■□□ 2.21
CHCHD4-201ENST00000295767 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms