RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258341.4

LAMC1-201, Transcript of laminin subunit gamma 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LAMC1, Length 7,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1-201ENST00000258341 MAGI2Q86UL8 1455 aa16.89■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 SMAPO00193 183 aa16.89■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 GLRA3O75311 464 aa16.89■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 RAP1GAPP47736 663 aa16.89■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 RHOAP61586 193 aa16.89■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 VAC14Q08AM6 782 aa16.89■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 AKIRIN2Q53H80 203 aa16.89■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa16.89■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 TMC7Q7Z402 723 aa16.89■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 JAMLQ86YT9 394 aa16.89■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 RPN2P04844 631 aa16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 CCDC130P13994 396 aa16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 ITGALP20701 1170 aa16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 CASP12Q6UXS9 341 aa16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 UBP1Q9NZI7 540 aa16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 SLC12A8A0AV02 714 aa16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 VAV1P15498 845 aa16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 MARSP56192 900 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 CACUL1Q86Y37 369 aa16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 PHF21BQ96EK2 531 aa16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 DEFB129Q9H1M3 183 aa16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 KCNH7Q9NS40 1196 aa16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 DPP7Q9UHL4 492 aa16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 VANGL2Q9ULK5 521 aa16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 ALG6Q9Y672 507 aa16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 THRAP10827 490 aa16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 VHLP40337 213 aa16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 FAM228AQ86W67 206 aa16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 COQ7Q99807 217 aa16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 NDUFS2O75306 463 aa16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 SCNN1BP51168 640 aa16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 ARF5P84085 180 aa16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 VCPKMTQ9H867 229 aa16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 HEY2Q9UBP5 337 aa16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 COILP38432 576 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 BIKQ13323 160 aa16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 ALG11Q2TAA5 492 aa16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 SPPL2AQ8TCT8 520 aa16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 CDHR2Q9BYE9 1310 aa16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 KANSL1LA0AUZ9 987 aa16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF286BP0CG31 522 aa16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 GARTP22102 1010 aa16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 PLD1Q13393 1074 aa16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 RASGRP2Q7LDG7 609 aa16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 LRRC4BQ9NT99 713 aa16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 ANAPC2Q9UJX6 822 aa16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 AP4E1Q9UPM8 1137 aa16.88■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 H3BMM5 538 aa16.87■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 RBBP4Q09028 425 aa16.87■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 GJB7Q6PEY0 223 aa16.87■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 VPS33AQ96AX1 596 aa16.87■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 KLHL3Q9UH77 587 aa16.87■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa16.87■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 RHOBTB3O94955 611 aa16.87■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 SP100P23497 879 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 IL2P60568 153 aa16.87■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 OVGP1Q12889 678 aa16.87■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 GNA13Q14344 377 aa16.87■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 POU6F1Q14863 301 aa16.87■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 FGD3Q5JSP0 725 aa16.87■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 LRRC6Q86X45 466 aa16.87■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 APOL2Q9BQE5 337 aa16.87■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 EVA1BQ9NVM1 165 aa16.87■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF839A8K0R7 811 aa16.87■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 BAIAP3O94812 1187 aa16.87■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 CYP2C8P10632 490 aa16.87■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 SLC2A4P14672 509 aa16.87■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 LHX1P48742 406 aa16.87■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 PSMD7P51665 324 aa16.87■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 TMEM26Q6ZUK4 368 aa16.87■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 C16orf86Q6ZW13 317 aa16.87■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 LRRC49Q8IUZ0 686 aa16.87■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF232Q9UNY5 417 aa16.87■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa16.87■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 MSH4O15457 936 aa16.87■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 NUP107P57740 925 aa16.87■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 CCDC144BQ3MJ40 725 aa16.87■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 STARD7Q9NQZ5 370 aa16.87■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 TUBE1Q9UJT0 475 aa16.87■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa16.87■□□□□ 0.29
LAMC1-201ENST00000258341 CCDC154A6NI56 674 aa16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms