RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000240159.8

RNF170-201, Transcript of ring finger protein 170, humanhuman

TSL 2

Gene RNF170, Length 2,023 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF170-201ENST00000240159 PLAAQ9Y263 795 aa23.55■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 TRIM43BA6NCK2 446 aa23.54■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 TBC1D4O60343 1298 aa23.54■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 TIMP1P01033 207 aa23.54■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 IFNB1P01574 187 aa23.54■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 MAGEA11P43364 429 aa23.54■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 SPDYCQ5MJ68 293 aa23.54■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 RSAD2Q8WXG1 361 aa23.54■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 TTPALQ9BTX7 342 aa23.54■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 TRIM62Q9BVG3 475 aa23.54■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 FAM204AQ9H8W3 233 aa23.54■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 COL4A6Q14031 1691 aa23.54■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa23.54■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 TRIM66O15016 1216 aa23.54■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 GOT1P17174 413 aa23.54■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 PMS2P54278 862 aa23.54■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 AIF1P55008 147 aa23.54■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 ARPP19P56211 112 aa23.54■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 GPS1Q13098 491 aa23.54■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 DDR2Q16832 855 aa23.54■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 UNC45BQ8IWX7 931 aa23.54■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 ATAD1Q8NBU5 361 aa23.54■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 NTAN1Q96AB6 310 aa23.54■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 ADAM7Q9H2U9 754 aa23.54■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 HEY1Q9Y5J3 304 aa23.54■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 LTBP2Q14767 1821 aa23.53■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 H7C4K7 107 aa23.53■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 F9P00740 461 aa23.53■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 ADRA1BP35368 520 aa23.53■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 ARL4AP40617 200 aa23.53■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 GPR15P49685 360 aa23.53■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP23.53■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 ROR1Q01973 937 aa23.53■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 SLMAPQ14BN4 828 aa23.53■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 EFHC2Q5JST6 749 aa23.53■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 SDHAF4Q5VUM1 108 aa23.53■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 ANKS3Q6ZW76 656 aa23.53■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 TOP1MTQ969P6 601 aa23.53■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 ANLNQ9NQW6 1124 aa23.53■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 AAASQ9NRG9 546 aa23.53■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP23.53■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 FBXW11Q9UKB1 542 aa23.53■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 H0YGN5 161 aa23.52■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 EFEMP2O95967 443 aa23.52■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 CPB1P15086 417 aa23.52■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 CSF2RAP15509 400 aa23.52■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 SCAPQ12770 1279 aa23.52■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 GPR17Q13304 367 aa23.52■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 NECAB2Q7Z6G3 386 aa23.52■■□□□ 1.36
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RNF170-201ENST00000240159 TTC9BQ8N6N2 239 aa23.52■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 NFS1Q9Y697 457 aa23.52■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 OPA1O60313 960 aa23.52■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 CHKAP35790 457 aa23.52■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 LRIG3Q6UXM1 1119 aa23.52■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa23.52■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 SCD5Q86SK9 330 aa23.52■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 NUP93Q8N1F7 819 aa23.52■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 FAM71DQ8N9W8 422 aa23.52■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 STKLD1Q8NE28 680 aa23.52■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 RNF139Q8WU17 664 aa23.52■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 EPB41L4BQ9H329 900 aa23.52■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 ABCC13Q9NSE7 274 aa23.52■■□□□ 1.36
RNF170-201ENST00000240159 H7C0C1 242 aa23.51■■□□□ 1.35
RNF170-201ENST00000240159 I6L893 689 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
RNF170-201ENST00000240159 KIAA0355O15063 1070 aa23.51■■□□□ 1.35
RNF170-201ENST00000240159 RARGP13631 454 aa23.51■■□□□ 1.35
RNF170-201ENST00000240159 AMPD1P23109 780 aa23.51■■□□□ 1.35
RNF170-201ENST00000240159 ATP5OP48047 213 aa23.51■■□□□ 1.35
RNF170-201ENST00000240159 CXCR3P49682 368 aa23.51■■□□□ 1.35
RNF170-201ENST00000240159 PGFP49763 221 aa23.51■■□□□ 1.35
RNF170-201ENST00000240159 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
RNF170-201ENST00000240159 CCDC25Q86WR0 208 aa23.51■■□□□ 1.35
RNF170-201ENST00000240159 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
RNF170-201ENST00000240159 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
RNF170-201ENST00000240159 MTMR11A4FU01 709 aa23.5■■□□□ 1.35
RNF170-201ENST00000240159 H3BRJ5 948 aa23.5■■□□□ 1.35
RNF170-201ENST00000240159 RNF40O75150 1001 aa23.5■■□□□ 1.35
RNF170-201ENST00000240159 AMHP03971 560 aa23.5■■□□□ 1.35
RNF170-201ENST00000240159 STIP1P31948 543 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
RNF170-201ENST00000240159 GBE1Q04446 702 aa23.5■■□□□ 1.35
RNF170-201ENST00000240159 BTBD8Q5XKL5 378 aa23.5■■□□□ 1.35
RNF170-201ENST00000240159 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa23.5■■□□□ 1.35
RNF170-201ENST00000240159 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
RNF170-201ENST00000240159 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
RNF170-201ENST00000240159 TSPYL1Q9H0U9 437 aa23.5■■□□□ 1.35
RNF170-201ENST00000240159 SEMA4AQ9H3S1 761 aa23.5■■□□□ 1.35
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