RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000223864.6

PLGRKT-201, Transcript of plasminogen receptor with a C-terminal lysine, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLGRKT, Length 932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLGRKT-201ENST00000223864 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa18.06■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 UBA3Q8TBC4 463 aa18.06■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 EPS8L1Q8TE68 723 aa18.06■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 KCTD13Q8WZ19 329 aa18.06■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 KREMEN1Q96MU8 473 aa18.06■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 SPHK2Q9NRA0 654 aa18.06■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 SLC8A2Q9UPR5 921 aa18.06■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 CNTN6Q9UQ52 1028 aa18.06■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 A0A0A0MRY4 1105 aa18.05■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 K7EQS6 105 aa18.05■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 MDM4O15151 490 aa18.05■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 SLC6A11P48066 632 aa18.05■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 ZNF132P52740 706 aa18.05■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP18.05■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 DPCR1Q3MIW9 517 aa18.05■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 SYT13Q7L8C5 426 aa18.05■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 TMEM25Q86YD3 366 aa18.05■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 CAMKK1Q8N5S9 505 aa18.05■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 ACDQ96AP0 544 aa18.05■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 ZSWIM1Q9BR11 485 aa18.05■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 ULBP1Q9BZM6 244 aa18.05■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP18.05■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa18.05■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 ZNF292O60281 2723 aa18.04■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa18.04■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 GDF9O60383 454 aa18.04■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 STC2O76061 302 aa18.04■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 KAT7O95251 611 aa18.04■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 APODP05090 189 aa18.04■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 COG7P83436 770 aa18.04■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 ADIGQ0VDE8 80 aa18.04■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 BTBD8Q5XKL5 378 aa18.04■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 WDR5BQ86VZ2 330 aa18.04■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 C12orf40Q86WS4 652 aa18.04■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 MIB1Q86YT6 1006 aa18.04■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa18.04■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 USP33Q8TEY7 942 aa18.04■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 SLC35F5Q8WV83 523 aa18.04■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 GBP4Q96PP9 640 aa18.04■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 THAP9Q9H5L6 903 aa18.04■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 DACH1Q9UI36 760 aa18.04■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 BRD2P25440 801 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 HOXC13P31276 330 aa18.03■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 GRIA2P42262 883 aa18.03■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 EFEMP1Q12805 493 aa18.03■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 ANO4Q32M45 955 aa18.03■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 C2orf27AQ580R0 203 aa18.03■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 TRIM65Q6PJ69 517 aa18.03■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 GBP6Q6ZN66 633 aa18.03■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 Q6ZNB5 142 aa18.03■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa18.03■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 BHLHA9Q7RTU4 235 aa18.03■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 FAM114A1Q8IWE2 563 aa18.03■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa18.03■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 SCML4Q8N228 414 aa18.03■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 FAM81BQ96LP2 452 aa18.03■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 HINFPQ9BQA5 517 aa18.03■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 CRACR2AQ9BSW2 395 aa18.03■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 CNGB3Q9NQW8 809 aa18.03■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 ARHGEF4Q9NR80 690 aa18.03■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 MARCH2Q9P0N8 246 aa18.03■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 NCDNQ9UBB6 729 aa18.03■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 RASAL2Q9UJF2 1139 aa18.03■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 RAB23Q9ULC3 237 aa18.03■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa18.02■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 TULP3O75386 442 aa18.02■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 DMDP11532 3685 aa18.02■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 KRT5P13647 590 aa18.02■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 SLC9A1P19634 815 aa18.02■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 TNFRSF4P43489 277 aa18.02■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 MFAP3P55082 362 aa18.02■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 MESP2Q0VG99 397 aa18.02■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 DMC1Q14565 340 aa18.02■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 LINC01559Q495D7 138 aa18.02■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 PMF1Q6P1K2 205 aa18.02■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 PHTF2Q8N3S3 785 aa18.02■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 DCLK2Q8N568 766 aa18.02■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 NAT16Q8N8M0 369 aa18.02■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 BAP1Q92560 729 aa18.02■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 DCLK3Q9C098 648 aa18.02■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
PLGRKT-201ENST00000223864 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms