RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000040584.5

HOXC8-201, Transcript of homeobox C8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC8, Length 1,889 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8-201ENST00000040584 RASAL2Q9UJF2 1139 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 CHD7Q9P2D1 2997 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 C5orf67F2Z3F1 127 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 PYGMP11217 842 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 ATF6P18850 670 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 MAGEA9P43362 315 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 TUFMP49411 452 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 CREMQ03060 361 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 TRADDQ15628 312 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 AGBL2Q5U5Z8 902 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 FAM172AQ8WUF8 416 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 SPATA17Q96L03 361 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 PCSK1NQ9UHG2 260 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 CHD9Q3L8U1 2897 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 CAPN9O14815 690 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 MIPP30301 263 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 PTPN9P43378 593 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 PGFP49763 221 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 PLPP4Q5VZY2 271 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 BSPRYQ5W0U4 402 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 AADACL2Q6P093 401 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 KATNAL2Q8IYT4 538 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 EDEM1Q92611 657 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 NCAM1P13591 858 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 IL1R2P27930 398 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 NOS2P35228 1153 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 PCK1P35558 622 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 POLNQ7Z5Q5 900 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 TBCBQ99426 244 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 FBXO44Q9H4M3 255 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 TLR9Q9NR96 1032 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 IL37Q9NZH6 218 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 SCML2Q9UQR0 700 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 NFS1Q9Y697 457 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 HIDE1A8MVS5 230 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 GRM6O15303 877 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 TTI1O43156 1089 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 DAPK3O43293 454 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 RB1P06400 928 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 SPATA31D3P0C874 917 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 SULT1E1P49888 294 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 DR1Q01658 176 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 SLC25A52Q3SY17 297 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 KCTD16Q68DU8 428 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 SCD5Q86SK9 330 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 KLHL5Q96PQ7 755 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 PBX4Q9BYU1 374 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 ZWILCHQ9H900 591 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 KLHL11Q9NVR0 708 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 HSFX1Q9UBD0 423 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 YWHAQP27348 245 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 CHRNA3P32297 505 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 HDAC4P56524 1084 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 HADHQ16836 314 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 SMTNL2Q2TAL5 461 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 NPY6RQ99463 290 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 ERP44Q9BS26 406 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 EPN3Q9H201 632 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 CERS4Q9HA82 394 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 NMUR1Q9HB89 426 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 USP18Q9UMW8 372 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 C2orf71A6NGG8 1288 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 SLC38A8A6NNN8 435 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 PRRG1O14668 218 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 DESP17661 470 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 ELF1P32519 619 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 MDH1P40925 334 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 CCT5P48643 541 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 UBE3AQ05086 875 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 CAMK1Q14012 370 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 KCNT1Q5JUK3 1230 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 SCYL2Q6P3W7 929 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 CROCCP2Q86T23 111 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 PPM1EQ8WY54 764 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 NT5C3BQ969T7 300 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 PEBP4Q96S96 227 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 FAM129AQ9BZQ8 928 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXC8-201ENST00000040584 YIPF1Q9Y548 306 aa22.9■■□□□ 1.26
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