RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639850.1

ME2-216, Transcript of malic enzyme 2, human

TSL 5 BASIC

Gene ME2, Length 2,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ME2-216	ENST00000639850	B3GAT3	O94766	335 aa		21.34	■■□□□ 1.01
ME2-216	ENST00000639850	ZBED1	O96006	694 aa		21.34	■■□□□ 1.01
ME2-216	ENST00000639850	ODC1	P11926	461 aa		21.34	■■□□□ 1.01
ME2-216	ENST00000639850	PCSK1	P29120	753 aa		21.34	■■□□□ 1.01
ME2-216	ENST00000639850	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	21.34	■■□□□ 1.01
ME2-216	ENST00000639850	FAM26D	Q5JW98	314 aa		21.34	■■□□□ 1.01
ME2-216	ENST00000639850	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		21.34	■■□□□ 1.01
ME2-216	ENST00000639850	SMO	Q99835	787 aa		21.34	■■□□□ 1.01
ME2-216	ENST00000639850	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	21.34	■■□□□ 1.01
ME2-216	ENST00000639850	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		21.34	■■□□□ 1.01
ME2-216	ENST00000639850	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		21.34	■■□□□ 1.01
ME2-216	ENST00000639850	HTT	P42858	3142 aa		21.34	■■□□□ 1.01
ME2-216	ENST00000639850	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	21.33	■■□□□ 1.01
ME2-216	ENST00000639850	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	21.33	■■□□□ 1.01
ME2-216	ENST00000639850	KIF3C	O14782	793 aa		21.33	■■□□□ 1.01
ME2-216	ENST00000639850	TMEM63A	O94886	807 aa		21.33	■■□□□ 1.01
ME2-216	ENST00000639850	HOXD10	P28358	340 aa		21.33	■■□□□ 1.01
ME2-216	ENST00000639850	RBL1	P28749	1068 aa		21.33	■■□□□ 1.01
ME2-216	ENST00000639850	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	21.33	■■□□□ 1.01
ME2-216	ENST00000639850	PDIK1L	Q8N165	341 aa		21.33	■■□□□ 1.01
ME2-216	ENST00000639850	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		21.33	■■□□□ 1.01
ME2-216	ENST00000639850	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		21.33	■■□□□ 1.01
ME2-216	ENST00000639850	KCNK16	Q96T55	309 aa		21.33	■■□□□ 1.01
ME2-216	ENST00000639850	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		21.33	■■□□□ 1.01
ME2-216	ENST00000639850	PAK5	Q9P286	719 aa		21.33	■■□□□ 1.01
ME2-216	ENST00000639850	FZD10	Q9ULW2	581 aa		21.33	■■□□□ 1.01
ME2-216	ENST00000639850	FBXO21	O94952	628 aa		21.33	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	SKI	P12755	728 aa		21.33	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	RABGGTB	P53611	331 aa		21.33	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	GRIK3	Q13003	919 aa		21.33	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	MSS51	Q4VC12	460 aa		21.33	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		21.33	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	CYP4X1	Q8N118	509 aa		21.33	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	21.33	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	NT5C3B	Q969T7	300 aa		21.33	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	RTP4	Q96DX8	246 aa		21.33	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	CAPNS2	Q96L46	248 aa		21.33	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	NPY6R	Q99463	290 aa		21.33	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		21.33	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		21.33	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		21.33	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		21.32	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	ARL4A	P40617	200 aa		21.32	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	21.32	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	METTL23	Q86XA0	190 aa		21.32	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		21.32	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	COX16	Q9P0S2	106 aa		21.32	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		21.32	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850		E7ESA3	106 aa		21.32	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850		M0QYT0	321 aa		21.32	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	NR2C2	P49116	596 aa		21.32	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	GBE1	Q04446	702 aa		21.32	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	21.32	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		21.32	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		21.32	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		21.32	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	21.32	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		21.32	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	21.32	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	TSC2	P49815	1807 aa		21.31	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	BRCA2	P51587	3418 aa		21.31	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		21.31	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	NRP1	O14786	923 aa		21.31	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	CREB1	P16220	341 aa		21.31	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	GOT1	P17174	413 aa		21.31	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	BRCC3	P46736	316 aa		21.31	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	TUSC3	Q13454	348 aa		21.31	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	21.31	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	21.31	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	21.31	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		21.31	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		21.31	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		21.31	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		21.31	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	EURL	Q9NYK6	297 aa		21.31	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		21.31	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	CAPN9	O14815	690 aa		21.3	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	CACNA2D1	P54289	1103 aa		21.3	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	DAOA	P59103	153 aa		21.3	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	21.3	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	NME3	Q13232	169 aa		21.3	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	XRCC4	Q13426	336 aa		21.3	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	TMED2	Q15363	201 aa		21.3	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		21.3	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	BBS9	Q3SYG4	887 aa		21.3	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		21.3	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	21.3	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		21.3	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	RAET1E	Q8TD07	263 aa		21.3	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	HASPIN	Q8TF76	798 aa		21.3	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		21.3	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		21.3	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	TMEM120B	A0PK00	339 aa		21.3	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	CHAD	O15335	359 aa		21.3	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	AMPD1	P23109	780 aa		21.3	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	GCA	P28676	217 aa		21.3	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	PHB	P35232	272 aa		21.3	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	GPX6	P59796	221 aa		21.3	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	DEUP1	Q05D60	604 aa		21.3	■■□□□ 1
ME2-216	ENST00000639850	KCNJ11	Q14654	390 aa		21.3	■■□□□ 1

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