RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 RNF112Q9ULX5 631 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 LRP6O75581 1613 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 APOC2P02655 101 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 AMHP03971 560 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 AGR3Q8TD06 166 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 TSC22D3Q99576 134 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 FICDQ9BVA6 458 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 LATS2Q9NRM7 1088 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 VANGL2Q9ULK5 521 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 RAD54BQ9Y620 910 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CHRM3P20309 590 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 YY1P25490 414 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ADCYAP1R1P41586 468 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 COPAP53621 1224 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 POU4F1Q01851 419 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ADIGQ0VDE8 80 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CDH17Q12864 832 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CNGA2Q16280 664 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SPDYAQ5MJ70 313 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ICE2Q659A1 982 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SZRD1Q7Z422 152 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 TMC3Q7Z5M5 1100 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 HTR3CQ8WXA8 447 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 TLR10Q9BXR5 811 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ABCC13Q9NSE7 274 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SLC12A8A0AV02 714 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CAND2O75155 1236 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 GLI1P08151 1106 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 TBX4P57082 545 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 OCA2Q04671 838 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 RPAINQ86UA6 219 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 LRRC34Q8IZ02 419 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 EPS8L1Q8TE68 723 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 LZICQ8WZA0 190 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 FAM111AQ96PZ2 611 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 TEKT2Q9UIF3 430 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CASTOR2A6NHX0 329 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CHADO15335 359 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 PMPCBO75439 489 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 GLP2RO95838 553 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 THRAP10827 490 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 EFEMP1Q12805 493 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ANKRD23Q86SG2 305 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 PPTC7Q8NI37 304 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 PKD2L2Q9NZM6 624 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 OPLAHO14841 1288 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 GHRP10912 638 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 PYGMP11217 842 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CRABP2P29373 138 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 MAP3K10Q02779 954 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 TMCO4Q5TGY1 634 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 PKN3Q6P5Z2 889 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CREG2Q8IUH2 290 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 MYO1HQ8N1T3 1032 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CARNMT1Q8N4J0 409 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CXorf38Q8TB03 319 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 APBA2Q99767 749 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 PCYOX1Q9UHG3 505 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 C5orf58C9J3I9 102 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ADCY6O43306 1168 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ADRB2P07550 413 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ITGALP20701 1170 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 RPL9P32969 192 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 KCNMA1Q12791 1236 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CACHD1Q5VU97 1274 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 PDPK2PQ6A1A2 396 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 STRA8Q7Z7C7 330 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 VPS37AQ8NEZ2 397 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 RNF217Q8TC41 542 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 FBXO25Q8TCJ0 367 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 FTHL17Q9BXU8 183 aa6.65□□□□□ -1.34
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