RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF410	Q86VK4	478 aa		13.58	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		13.58	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC185	Q8N715	623 aa		13.58	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		13.58	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		13.58	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	COL1A2	P08123	1366 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	SPTLC1	O15269	473 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	RIPK1	Q13546	671 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	CCL15	Q16663	113 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	GPR142	Q7Z601	462 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	FAM131B	Q86XD5	332 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	MPP5	Q8N3R9	675 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	RNF39	Q9H2S5	420 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	DPYSL4	O14531	572 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	T-ENOL	P0DO92	83 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	AMPD1	P23109	780 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	L1CAM	P32004	1257 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	MAP2K2	P36507	400 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	WLS	Q5T9L3	541 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	NOTUM	Q6P988	496 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	TEKT4	Q8WW24	435 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	MAML3	Q96JK9	1138 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	TBCB	Q99426	244 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF670	Q9BS34	389 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	MECR	Q9BV79	373 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	CEP41	Q9BYV8	373 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	VPS11	Q9H270	941 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	COPE	O14579	308 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	MDM4	O15151	490 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	GOT1	P17174	413 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	VPS52	Q8N1B4	723 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	APOPT1	Q96IL0	206 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	CYLD	Q9NQC7	956 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	GPR32	O75388	356 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	CRADD	P78560	199 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	ZBTB6	Q15916	424 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	TINF2	Q9BSI4	451 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	CFAP69	A5D8W1	941 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	KPNA7	A9QM74	516 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	ANP32D	O95626	131 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	CYP2C9	P11712	490 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	ETV4	P43268	484 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	MROH9	Q5TGP6	573 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	LGMN	Q99538	433 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	C2CD2L	O14523	706 aa		13.56	□□□□□ -0.24

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