RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 NDST1P52848 882 aa20.32■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 STX17P56962 302 aa20.32■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 PAK1Q13153 545 aa20.32■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 ORC1Q13415 861 aa20.32■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 CCDC40Q4G0X9 1142 aa20.32■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 TTI2Q6NXR4 508 aa20.32■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 CLEC17AQ6ZS10 378 aa20.32■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa20.32■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 ACOT1Q86TX2 421 aa20.32■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 PGBD3Q8N328 593 aa20.32■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 RIN3Q8TB24 985 aa20.32■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 RLN3Q8WXF3 142 aa20.32■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 SEMA4DQ92854 862 aa20.32■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 SPATA17Q96L03 361 aa20.32■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 MED10Q9BTT4 135 aa20.32■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa20.32■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 ELOVL4Q9GZR5 314 aa20.32■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 NIF3L1Q9GZT8 377 aa20.32■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 CAPN10Q9HC96 672 aa20.32■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 RAB20Q9NX57 234 aa20.32■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa20.32■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 ATP8B3O60423 1300 aa20.31■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 F8VP50 259 aa20.31■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 APODP05090 189 aa20.31■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 CBWD6Q4V339 395 aa20.31■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 CBWD3Q5JTY5 395 aa20.31■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 CBWD5Q5RIA9 395 aa20.31■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 UNC93AQ86WB7 457 aa20.31■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 SH3RF2Q8TEC5 729 aa20.31■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 CYP3A43Q9HB55 503 aa20.31■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 SUSD2Q9UGT4 822 aa20.31■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 HMGXB4Q9UGU5 601 aa20.31■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 CEP192Q8TEP8 1941 aa20.31■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 HELZP42694 1942 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 FTH1P19P0C7X4 201 aa20.3■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 CD58P19256 250 aa20.3■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 ITPKAP23677 461 aa20.3■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 OPRD1P41143 372 aa20.3■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 C19orf57Q0VDD7 668 aa20.3■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 MAP7D1Q3KQU3 841 aa20.3■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 FOXR2Q6PJQ5 311 aa20.3■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa20.3■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 HMGB4Q8WW32 186 aa20.3■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 SLC35C1Q96A29 364 aa20.3■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 C8orf48Q96LL4 319 aa20.3■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 CEP295NLQ96MC4 621 aa20.3■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 GBP4Q96PP9 640 aa20.3■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 PNKPQ96T60 521 aa20.3■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 CLSTN2Q9H4D0 955 aa20.3■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 DKK4Q9UBT3 224 aa20.3■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa20.29■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 CD59P13987 128 aa20.29■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 CACNA2D1P54289 1103 aa20.29■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 INCA1Q0VD86 236 aa20.29■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 TMEM92Q6UXU6 159 aa20.29■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 NUDT18Q6ZVK8 323 aa20.29■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 FAM35AQ86V20 835 aa20.29■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 ALLCQ8N6M5 410 aa20.29■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 KCNV2Q8TDN2 545 aa20.29■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 LMBRD1Q9NUN5 540 aa20.29■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 EHD2Q9NZN4 543 aa20.29■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 PCDH15Q96QU1 1955 aa20.28■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa20.28■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 TADA3O75528 432 aa20.28■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 CCDC130P13994 396 aa20.28■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 HDCP19113 662 aa20.28■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 FAM193AP78312 1265 aa20.28■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF33AQ06730 810 aa20.28■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 CRYBG2Q8N1P7 616 aa20.28■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 IL17RCQ8NAC3 791 aa20.28■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 LRIG1Q96JA1 1093 aa20.28■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 NT5C1AQ9BXI3 368 aa20.28■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa20.28■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 NUP62CLQ9H1M0 184 aa20.28■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 FAM49BQ9NUQ9 324 aa20.28■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 TMEM30AQ9NV96 361 aa20.28■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 APC2O95996 2303 aa20.27■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF217O75362 1048 aa20.27■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 KAT7O95251 611 aa20.27■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 ADH1CP00326 375 aa20.27■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 GNSP15586 552 aa20.27■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 TIE1P35590 1138 aa20.27■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 GRIA2P42262 883 aa20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms