RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602499.5

UBE2E3-207, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2E3, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-207ENST00000602499 CPQQ9Y646 472 aa22.98■■□□□ 1.27
UBE2E3-207ENST00000602499 LEFTY2O00292 366 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-207ENST00000602499 COG7P83436 770 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-207ENST00000602499 ZXDBP98169 803 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-207ENST00000602499 USP4Q13107 963 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-207ENST00000602499 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-207ENST00000602499 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-207ENST00000602499 MON1BQ7L1V2 547 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-207ENST00000602499 SH3RF2Q8TEC5 729 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-207ENST00000602499 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.278e-7■■■■□ 20
UBE2E3-207ENST00000602499 LRRC3BQ96PB8 259 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-207ENST00000602499 SLC2A13Q96QE2 648 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-207ENST00000602499 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-207ENST00000602499 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-207ENST00000602499 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-207ENST00000602499 RTN2O75298 545 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3-207ENST00000602499 NCAM1P13591 858 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3-207ENST00000602499 GOLGA8FQ08AF8 430 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3-207ENST00000602499 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3-207ENST00000602499 UBALD2Q8IYN6 164 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3-207ENST00000602499 EDEM1Q92611 657 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3-207ENST00000602499 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3-207ENST00000602499 C11orf70Q9BRQ4 267 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3-207ENST00000602499 ISCUQ9H1K1 167 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3-207ENST00000602499 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3-207ENST00000602499 TMEM51Q9NW97 253 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3-207ENST00000602499 MARCH2Q9P0N8 246 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3-207ENST00000602499 NUDT5Q9UKK9 219 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3-207ENST00000602499 E2F8A0AVK6 867 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 CAPN9O14815 690 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 CHADO15335 359 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 SRFP11831 508 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 EFEMP1Q12805 493 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 TAF5Q15542 800 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 YAF2Q8IY57 180 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 MCOLN2Q8IZK6 566 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 PANX2Q96RD6 677 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 TRPV5Q9NQA5 729 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 RRN3Q9NYV6 651 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 DUSP12Q9UNI6 340 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 FTLP02792 175 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 NNTQ13423 1086 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 MTF1Q14872 753 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 C2CD6Q53TS8 623 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 C3orf20Q8ND61 904 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 IRF7Q92985 503 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 SMOC2Q9H3U7 446 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 SMPD4Q9NXE4 827 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 TAS2R14Q9NYV8 317 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 TMEM59LQ9UK28 342 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 TRIOO75962 3097 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 A0A087X0T9 212 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 ZNF263O14978 683 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 DAB1O75553 588 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 FAM228BP0C875 321 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 NOS2P35228 1153 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 MATKP42679 507 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 PFKPQ01813 784 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 SLC18A3Q16572 532 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 HTR3DQ70Z44 454 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 MIB1Q86YT6 1006 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 RIN3Q8TB24 985 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 TRIM11Q96F44 468 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 GKN1Q9NS71 199 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 CFAP97Q9P2B7 532 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 MUTYHQ9UIF7 546 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 RASAL2Q9UJF2 1139 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 NENFQ9UMX5 172 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 MDM4O15151 490 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 MYBL1P10243 752 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 GRM2Q14416 872 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 PDGFRLQ15198 375 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 DCAF6Q58WW2 860 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 SYPL2Q5VXT5 272 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 DEFB106AQ8N104 65 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 OSCP1Q8WVF1 389 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 DNASE1L2Q92874 299 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 NT5C3BQ969T7 300 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 PLD4Q96BZ4 506 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 OTUB2Q96DC9 234 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 CCDC42Q96M95 316 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 SERPINB11Q96P15 392 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2E3-207ENST00000602499 CHP1Q99653 195 aa22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms