RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591971.5

PDE4A-208, Transcript of phosphodiesterase 4A, human

TSL 5

Gene PDE4A, Length 836 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4A-208	ENST00000591971	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	13.14	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	PMM2	O15305	246 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	ADAM23	O75077	832 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	CLSTN1	O94985	981 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	RARG	P13631	454 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	SEC13	P55735	322 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	13.13	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	PNKP	Q96T60	521 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	FANCL	Q9NW38	375 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	KCNJ18	B7U540	433 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	SGK1	O00141	431 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	DCLK1	O15075	740 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	AXIN1	O15169	862 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	P4HA2	O15460	535 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	GDF9	O60383	454 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	GABBR2	O75899	941 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	EPN2	O95208	641 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	KAT7	O95251	611 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	KLKB1	P03952	638 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	IRF1	P10914	325 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	FOXK2	Q01167	660 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	CUL2	Q13617	745 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	KCNJ12	Q14500	433 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	IQCB1	Q15051	598 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	CSRP2	Q16527	193 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	PLK5	Q496M5	336 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	PKDCC	Q504Y2	493 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	C2orf27A	Q580R0	203 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	MIB1	Q86YT6	1006 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	EXOC4	Q96A65	974 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	ACD	Q96AP0	544 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	CD248	Q9HCU0	757 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	MARK1	Q9P0L2	795 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	RAB23	Q9ULC3	237 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	USP18	Q9UMW8	372 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	TULP3	O75386	442 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	APBB3	O95704	486 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	ADH1C	P00326	375 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	TPM3	P06753	285 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	CISD3	P0C7P0	127 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	GRIA2	P42262	883 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	TNFRSF4	P43489	277 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	FMO5	P49326	533 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	GAD2	Q05329	585 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	CRY1	Q16526	586 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	CEP68	Q76N32	757 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	PIGZ	Q86VD9	579 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	NAT16	Q8N8M0	369 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	KAT5	Q92993	513 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	LOXL4	Q96JB6	756 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	MED15	Q96RN5	788 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	FBXO10	Q9UK96	956 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PDE4A-208	ENST00000591971	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		13.1	□□□□□ -0.31

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