RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591956.1

SNHG16-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 16, human

TSL 2

Gene SNHG16, Length 556 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG16-208	ENST00000591956	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	FANCC	Q00597	558 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	CDR2	Q01850	454 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	RING1	Q06587	406 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	PDCL	Q13371	301 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	FZD5	Q13467	585 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	CPA6	Q8N4T0	437 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	RIN3	Q8TB24	985 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	RNF139	Q8WU17	664 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	TSPY26P	Q9H489	355 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	ECT2	Q9H8V3	914 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	ACP6	Q9NPH0	428 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	HPS4	Q9NQG7	708 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	CA14	Q9ULX7	337 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	COL4A2	P08572	1712 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956		A0A1W2PQJ5	194 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	EPHB6	O15197	1021 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	FER	P16591	822 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	CHKA	P35790	457 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	IFNAR2	P48551	515 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	KLK7	P49862	253 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	MTA1	Q13330	715 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956		Q6ZNB5	142 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	PJA1	Q8NG27	643 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	FAM3C	Q92520	227 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	BAP1	Q92560	729 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	PLD4	Q96BZ4	506 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	ST7	Q9NRC1	585 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	RRN3	Q9NYV6	651 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	USP34	Q70CQ2	3546 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	FAM170B	A6NMN3	283 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956		H0Y858	1186 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	STC2	O76061	302 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	CALCA	P01258	141 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	FYN	P06241	537 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	CTH	P32929	405 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	GJA4	P35212	333 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	RGS7	P49802	495 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	SLC6A3	Q01959	620 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	C18orf8	Q96DM3	657 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	CPXM1	Q96SM3	734 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	EBF3	Q9H4W6	596 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	MARK1	Q9P0L2	795 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SNHG16-208	ENST00000591956	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		11.9	□□□□□ -0.51

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