RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 SPATA20Q8TB22 786 aa19.24■□□□□ 0.67
CTIF-206ENST00000588345 EEF2KMTQ96G04 330 aa19.24■□□□□ 0.67
CTIF-206ENST00000588345 TMEM176AQ96HP8 235 aa19.24■□□□□ 0.67
CTIF-206ENST00000588345 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
CTIF-206ENST00000588345 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
CTIF-206ENST00000588345 BBS2Q9BXC9 721 aa19.24■□□□□ 0.67
CTIF-206ENST00000588345 WDR35Q9P2L0 1181 aa19.24■□□□□ 0.67
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CTIF-206ENST00000588345 COQ4Q9Y3A0 265 aa19.24■□□□□ 0.67
CTIF-206ENST00000588345 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa19.23■□□□□ 0.67
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CTIF-206ENST00000588345 C10orf120Q5SQS8 335 aa19.23■□□□□ 0.67
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CTIF-206ENST00000588345 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa19.23■□□□□ 0.67
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CTIF-206ENST00000588345 RALAP11233 206 aa19.22■□□□□ 0.67
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CTIF-206ENST00000588345 CYP2U1Q7Z449 544 aa19.22■□□□□ 0.67
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CTIF-206ENST00000588345 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP19.22■□□□□ 0.67
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CTIF-206ENST00000588345 GABRG3Q99928 467 aa19.2■□□□□ 0.66
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CTIF-206ENST00000588345 PGBD3Q8N328 593 aa19.19■□□□□ 0.66
CTIF-206ENST00000588345 SLC35C1Q96A29 364 aa19.19■□□□□ 0.66
CTIF-206ENST00000588345 ACOX2Q99424 681 aa19.19■□□□□ 0.66
CTIF-206ENST00000588345 DCLK3Q9C098 648 aa19.19■□□□□ 0.66
CTIF-206ENST00000588345 RASAL2Q9UJF2 1139 aa19.19■□□□□ 0.66
CTIF-206ENST00000588345 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa19.19■□□□□ 0.66
CTIF-206ENST00000588345 LAMA1P25391 3075 aa19.19■□□□□ 0.66
CTIF-206ENST00000588345 CEP192Q8TEP8 1941 aa19.19■□□□□ 0.66
CTIF-206ENST00000588345 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa19.18■□□□□ 0.66
CTIF-206ENST00000588345 PATE3B3GLJ2 98 aa19.18■□□□□ 0.66
CTIF-206ENST00000588345 MAP3K13O43283 966 aa19.18■□□□□ 0.66
CTIF-206ENST00000588345 KCNK5O95279 499 aa19.18■□□□□ 0.66
CTIF-206ENST00000588345 PMLP29590 882 aa19.18■□□□□ 0.66
CTIF-206ENST00000588345 DPP6P42658 865 aa19.18■□□□□ 0.66
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