RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 FUT10Q6P4F1 479 aa30.3■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCDC185Q8N715 623 aa30.3■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 P3H4Q92791 437 aa30.3■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 TXLNGYQ9BZA5 131 aa30.3■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 GPR62Q9BZJ7 368 aa30.3■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 TSPYL1Q9H0U9 437 aa30.3■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa30.3■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 AGPSO00116 658 aa30.3■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 NDC80O14777 642 aa30.3■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 OPA1O60313 960 aa30.3■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR4Q2P0C623 313 aa30.3■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 HSD17B3P37058 310 aa30.3■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC9A4Q6AI14 798 aa30.3■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 VSTM1Q6UX27 236 aa30.3■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 BEND5Q7L4P6 421 aa30.3■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 BHLHA9Q7RTU4 235 aa30.3■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM131BQ86XD5 332 aa30.3■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 CEP57Q86XR8 500 aa30.3■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZIM3Q96PE6 472 aa30.3■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa30.3■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 NCAM1P13591 858 aa30.29■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 CYP2F1P24903 491 aa30.29■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLMAPQ14BN4 828 aa30.29■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 NOMO1Q15155 1222 aa30.29■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 SGK1O00141 431 aa30.28■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 F9P00740 461 aa30.28■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 CAPN2P17655 700 aa30.28■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM193AP78312 1265 aa30.28■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP30.28■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC7A14Q8TBB6 771 aa30.28■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 PIK3R5Q8WYR1 880 aa30.28■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM121Q9BTD3 319 aa30.28■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 PCDH9Q9HC56 1237 aa30.28■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 ANAPC5Q9UJX4 755 aa30.28■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa30.28■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 H7C4K7 107 aa30.27■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 SYF2O95926 243 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 ITGA8P53708 1063 aa30.27■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 RHBDF2Q6PJF5 856 aa30.27■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 LRIG3Q6UXM1 1119 aa30.27■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 PQLC3Q8N755 202 aa30.27■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 PLD5Q8N7P1 536 aa30.27■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 PCDH19Q8TAB3 1148 aa30.27■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 MTMR10Q9NXD2 777 aa30.27■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRIM66O15016 1216 aa30.27■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 MAGEA11P43364 429 aa30.27■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 VPS41P49754 854 aa30.27■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 NME3Q13232 169 aa30.27■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa30.27■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 RSAD2Q8WXG1 361 aa30.27■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 NTAN1Q96AB6 310 aa30.27■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 C8orf48Q96LL4 319 aa30.27■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa30.27■■■□□ 2.44
CTDNEP1-208ENST00000573600 TNFRSF10BO14763 440 aa30.26■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 RBP3P10745 1247 aa30.26■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 ARL4AP40617 200 aa30.26■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC5A3P53794 718 aa30.26■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP30.26■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 BSPRYQ5W0U4 402 aa30.26■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa30.26■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 SH3GL2Q99962 352 aa30.26■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 PIGVQ9NUD9 493 aa30.26■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 HCSTQ9UBK5 93 aa30.26■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa30.25■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 TP73O15350 636 aa30.25■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 DGKIO75912 1065 aa30.25■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 UPP2O95045 317 aa30.25■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 PMS2P54278 862 aa30.25■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 SMARCB1Q12824 385 aa30.25■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 IZUMO3Q5VZ72 239 aa30.25■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 SCN4BQ8IWT1 228 aa30.25■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 PLAAQ9Y263 795 aa30.25■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 LTBP2Q14767 1821 aa30.25■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa30.25■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 STIP1P31948 543 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 ROR1Q01973 937 aa30.25■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 LRRC26Q2I0M4 334 aa30.25■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 P3H1Q32P28 736 aa30.25■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 EFHC2Q5JST6 749 aa30.25■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 ANKS3Q6ZW76 656 aa30.25■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 FOXP3Q9BZS1 431 aa30.25■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 COX16Q9P0S2 106 aa30.25■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa30.24■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 RARGP13631 454 aa30.24■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms