RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569304.1

RAB11A-208, Transcript of RAB11A, member RAS oncogene family, human

TSL 3

Gene RAB11A, Length 347 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB11A-208	ENST00000569304	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	DKK3	Q9UBP4	350 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	YY2	O15391	372 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	SPRY2	O43597	315 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	LARGE1	O95461	756 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	ONECUT2	O95948	504 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	FES	P07332	822 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	TMEM225B	P0DP42	221 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	YY1	P25490	414 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	SERPINA4	P29622	427 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	GK	P32189	559 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	MCM2	P49736	904 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	CCR5	P51681	352 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	PTPRR	Q15256	657 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	ST3GAL2	Q16842	350 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	GALNTL6	Q49A17	601 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	GGN	Q86UU5	652 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	PALM2	Q8IXS6	379 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	OR4N4	Q8N0Y3	316 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	ESX1	Q8N693	406 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	ASB10	Q8WXI3	467 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	RFK	Q969G6	155 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	R3HDM4	Q96D70	268 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	TWNK	Q96RR1	684 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	TMEM160	Q9NX00	188 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	PIPSL	A2A3N6	862 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304		M0QZQ0	153 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	PSMD9	O00233	223 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	PMPCB	O75439	489 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	CYP21A2	P08686	494 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	C1S	P09871	688 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	DRD1	P21728	446 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	GSTM5	P46439	218 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	CLCN2	P51788	898 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	DGKQ	P52824	942 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	UBE3A	Q05086	875 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	RPS6KA2	Q15349	733 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	CYP1B1	Q16678	543 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	NRN1L	Q496H8	165 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	HMGB4	Q8WW32	186 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	HAS1	Q92839	578 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	SKA1	Q96BD8	255 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	COG8	Q96MW5	612 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	EHD3	Q9NZN3	535 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	KCND3	Q9UK17	655 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	KRT38	O76015	456 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	TJP3	O95049	919 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	ITGAM	P11215	1152 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	ZNF20	P17024	532 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	RXRA	P19793	462 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	PCSK6	P29122	969 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	MCM5	P33992	734 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	TUB	P50607	506 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	VAMP2	P63027	116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	MPP1	Q00013	466 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	CHRND	Q07001	517 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	SEMA3B	Q13214	749 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	BMPR2	Q13873	1038 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	P3H1	Q32P28	736 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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