RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566637.5

CTU2-208, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTU2, Length 1,619 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-208ENST00000566637 HDAC7Q8WUI4 952 aa21.44■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 C1orf54Q8WWF1 131 aa21.44■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 DPF3Q92784 378 aa21.44■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 CLSTN3Q9BQT9 956 aa21.44■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 LRRC19Q9H756 370 aa21.44■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 RASAL2Q9UJF2 1139 aa21.44■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 AP4E1Q9UPM8 1137 aa21.44■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa21.44■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 PLXNA3P51805 1871 aa21.44■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 FAM187AA6NFU0 413 aa21.44■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 SOAT2O75908 522 aa21.44■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 YWHAQP27348 245 aa21.44■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 COILP38432 576 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 VSNL1P62760 191 aa21.44■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa21.44■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 FAM131BQ86XD5 332 aa21.44■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 VSIG1Q86XK7 387 aa21.44■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 IFT20Q8IY31 132 aa21.44■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 GPR65Q8IYL9 337 aa21.44■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 DCLK3Q9C098 648 aa21.44■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 CRISPLD1Q9H336 500 aa21.44■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 DDIT4Q9NX09 232 aa21.44■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 CD48P09326 243 aa21.43■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 DNAJB2P25686 324 aa21.43■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 GBP1P32455 592 aa21.43■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 ARSEP51690 589 aa21.43■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 GUCY2DQ02846 1103 aa21.43■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 DPYSL3Q14195 570 aa21.43■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 MON1AQ86VX9 555 aa21.43■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 CCDC105Q8IYK2 499 aa21.43■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 CCDC185Q8N715 623 aa21.43■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 STKLD1Q8NE28 680 aa21.43■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 FBXO32Q969P5 355 aa21.43■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 CEP295NLQ96MC4 621 aa21.43■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 PCDH18Q9HCL0 1135 aa21.43■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa21.43■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 HSFX1Q9UBD0 423 aa21.43■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 PCYOX1Q9UHG3 505 aa21.43■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 FZD10Q9ULW2 581 aa21.43■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 A0A1W2PQH9 124 aa21.42■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 CCDC151A5D8V7 595 aa21.42■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 TTI1O43156 1089 aa21.42■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 AIF1P55008 147 aa21.42■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 SNX1Q13596 522 aa21.42■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 TFDP2Q14188 446 aa21.42■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 CCNG2Q16589 344 aa21.42■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 BBS12Q6ZW61 710 aa21.42■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 TTC13Q8NBP0 860 aa21.42■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 ZNF461Q8TAF7 563 aa21.42■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 ADAM32Q8TC27 787 aa21.42■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 GPR152Q8TDT2 470 aa21.42■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 GRK7Q8WTQ7 553 aa21.42■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 RNF139Q8WU17 664 aa21.42■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 RAB17Q9H0T7 212 aa21.42■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa21.42■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 PIGVQ9NUD9 493 aa21.42■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 IL37Q9NZH6 218 aa21.42■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 ZNF487B1APH4 448 aa21.41■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 CST8O60676 142 aa21.41■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 ZMYND10O75800 440 aa21.41■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 CA8P35219 290 aa21.41■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 RAB33AQ14088 237 aa21.41■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 DPYSL2Q16555 572 aa21.41■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 CA9Q16790 459 aa21.41■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 EFHC2Q5JST6 749 aa21.41■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 TTC27Q6P3X3 843 aa21.41■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 SCD5Q86SK9 330 aa21.41■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 TAC4Q86UU9 113 aa21.41■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 ATG4AQ8WYN0 398 aa21.41■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 ZNF670Q9BS34 389 aa21.41■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 ZBP1Q9H171 429 aa21.41■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 EPB41L5Q9HCM4 733 aa21.41■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 GMIPQ9P107 970 aa21.41■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 FNIP2Q9P278 1114 aa21.41■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 SLC38A8A6NNN8 435 aa21.4■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 ABLIM3O94929 683 aa21.4■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 ECEL1O95672 775 aa21.4■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 LINC00271P0C7V0 271 aa21.4■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 USP46P62068 366 aa21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms