RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550376.5

PRDM4-205, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM4, Length 2,591 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-205ENST00000550376 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 A0A1W2PQY0 241 aa21.79■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 MDM4O15151 490 aa21.79■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 SLC25A52Q3SY17 297 aa21.79■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 EXOC3L1Q86VI1 746 aa21.79■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa21.79■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 TEKT4Q8WW24 435 aa21.79■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 MYLPFQ96A32 169 aa21.79■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 VPS37BQ9H9H4 285 aa21.79■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 PIGVQ9NUD9 493 aa21.79■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 DDHD2O94830 711 aa21.78■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 OR4Q2P0C623 313 aa21.78■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 SLC7A14Q8TBB6 771 aa21.78■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 SH3TC2Q8TF17 1288 aa21.78■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 CSPG4P5Q96PW8 444 aa21.78■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 MLXIPLQ9NP71 852 aa21.78■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 ANLNQ9NQW6 1124 aa21.78■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 LAMA3Q16787 3333 aa21.78■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 E7EVH7 732 aa21.78■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 CREB3O43889 395 aa21.78■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 HOXD10P28358 340 aa21.78■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 RPL9P32969 192 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 TRAF7Q6Q0C0 670 aa21.78■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 NAT8LQ8N9F0 302 aa21.78■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 CCDC110Q8TBZ0 833 aa21.78■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 LINC01599Q8WXQ3 324 aa21.78■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 TSPYL1Q9H0U9 437 aa21.78■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 STARD7Q9NQZ5 370 aa21.78■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa21.77■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 CAPN9O14815 690 aa21.77■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 CHN1P15882 459 aa21.77■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 DESP17661 470 aa21.77■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 DPYSL2Q16555 572 aa21.77■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 SLC9A4Q6AI14 798 aa21.77■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 TP53INP2Q8IXH6 220 aa21.77■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 PPIL6Q8IXY8 311 aa21.77■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 TMEM86AQ8N2M4 240 aa21.77■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 THSD7BQ9C0I4 1608 aa21.77■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 NCAM1P13591 858 aa21.77■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 SSTR1P30872 391 aa21.77■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 HIF1AQ16665 826 aa21.77■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 BBS9Q3SYG4 887 aa21.77■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa21.77■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 SCAMP5Q8TAC9 235 aa21.77■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 MGARPQ8TDB4 240 aa21.77■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 TMEM109Q9BVC6 243 aa21.77■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 DNAI2Q9GZS0 605 aa21.77■■□□□ 1.08
PRDM4-205ENST00000550376 I6L893 689 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
PRDM4-205ENST00000550376 TUSC3Q13454 348 aa21.76■■□□□ 1.07
PRDM4-205ENST00000550376 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
PRDM4-205ENST00000550376 RAB6BQ9NRW1 208 aa21.76■■□□□ 1.07
PRDM4-205ENST00000550376 CDH9Q9ULB4 789 aa21.76■■□□□ 1.07
PRDM4-205ENST00000550376 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
PRDM4-205ENST00000550376 FAM72CH0Y354 149 aa21.76■■□□□ 1.07
PRDM4-205ENST00000550376 NDUFAB1O14561 156 aa21.76■■□□□ 1.07
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PRDM4-205ENST00000550376 RAB27AP51159 221 aa21.76■■□□□ 1.07
PRDM4-205ENST00000550376 LRRC14Q15048 493 aa21.76■■□□□ 1.07
PRDM4-205ENST00000550376 CLLU1OSQ5K130 101 aa21.76■■□□□ 1.07
PRDM4-205ENST00000550376 FAM72AQ5TYM5 149 aa21.76■■□□□ 1.07
PRDM4-205ENST00000550376 FAM72DQ6L9T8 149 aa21.76■■□□□ 1.07
PRDM4-205ENST00000550376 FAM72BQ86X60 149 aa21.76■■□□□ 1.07
PRDM4-205ENST00000550376 RSPH1Q8WYR4 309 aa21.76■■□□□ 1.07
PRDM4-205ENST00000550376 KCTD13Q8WZ19 329 aa21.76■■□□□ 1.07
PRDM4-205ENST00000550376 PGBD4Q96DM1 585 aa21.76■■□□□ 1.07
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF670Q9BS34 389 aa21.76■■□□□ 1.07
PRDM4-205ENST00000550376 POPDC2Q9HBU9 364 aa21.76■■□□□ 1.07
PRDM4-205ENST00000550376 CYLDQ9NQC7 956 aa21.76■■□□□ 1.07
PRDM4-205ENST00000550376 DNAJB4Q9UDY4 337 aa21.76■■□□□ 1.07
PRDM4-205ENST00000550376 FZD10Q9ULW2 581 aa21.76■■□□□ 1.07
PRDM4-205ENST00000550376 SNX10Q9Y5X0 201 aa21.76■■□□□ 1.07
PRDM4-205ENST00000550376 AGTP01019 485 aa21.75■■□□□ 1.07
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PRDM4-205ENST00000550376 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
PRDM4-205ENST00000550376 NPY6RQ99463 290 aa21.75■■□□□ 1.07
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PRDM4-205ENST00000550376 SHOC2Q9UQ13 582 aa21.75■■□□□ 1.07
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PRDM4-205ENST00000550376 DAOAP59103 153 aa21.75■■□□□ 1.07
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PRDM4-205ENST00000550376 FAM26DQ5JW98 314 aa21.75■■□□□ 1.07
PRDM4-205ENST00000550376 CENPUQ71F23 418 aa21.75■■□□□ 1.07
PRDM4-205ENST00000550376 LGMNQ99538 433 aa21.75■■□□□ 1.07
PRDM4-205ENST00000550376 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
PRDM4-205ENST00000550376 EPN3Q9H201 632 aa21.75■■□□□ 1.07
PRDM4-205ENST00000550376 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
PRDM4-205ENST00000550376 HCSTQ9UBK5 93 aa21.75■■□□□ 1.07
PRDM4-205ENST00000550376 ALOX15BO15296 676 aa21.74■■□□□ 1.07
PRDM4-205ENST00000550376 DAB1O75553 588 aa21.74■■□□□ 1.07
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