RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 ADCK2Q7Z695 626 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 HSFY1Q96LI6 401 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 CDH9Q9ULB4 789 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 PGK2P07205 417 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 SERPINF2P08697 491 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 ACADSP16219 412 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 RARRES1P49788 294 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 C16orf72Q14CZ0 275 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 ARPINQ7Z6K5 226 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM199Q8N511 208 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 CDCA5Q96FF9 252 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 AGAP3Q96P47 875 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 PLA2G4CQ9UP65 541 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 NR2E3Q9Y5X4 410 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 SLC12A8A0AV02 714 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 TTLL13PA6NNM8 815 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM114B3SHH9 223 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 UPP2O95045 317 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 OR56A5P0C7T3 313 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 TKTL1P51854 596 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 SLC6A3Q01959 620 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 CNGA3Q16281 694 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 C16orf87Q6PH81 154 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 RPAINQ86UA6 219 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 SEMA6BQ9H3T3 888 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 L2HGDHQ9H9P8 463 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 EFCAB1Q9HAE3 211 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 H3BQF6 201 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 KRT6AP02538 564 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 KRT6BP04259 564 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 INSRRP14616 1297 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 KRT6CP48668 564 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 SARSP49591 514 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 RAD23BP54727 409 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 IKBKEQ14164 716 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 MDH1BQ5I0G3 518 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 CBWD2Q8IUF1 395 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 ZBTB9Q96C00 473 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 HINFPQ9BQA5 517 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 GIT1Q9Y2X7 761 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM120BA0PK00 339 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 ACO1P21399 889 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 TNFRSF8P28908 595 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 KATNAL2Q8IYT4 538 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 CARNMT1Q8N4J0 409 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 ANKRD7Q92527 254 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 CEP44Q9C0F1 390 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 KLC4Q9NSK0 619 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 C2CD2Q9Y426 696 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 ESYT3A0FGR9 886 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 RAD51BO15315 384 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 CLCN3P51790 818 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 PTENP60484 403 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 PPARDQ03181 441 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 PCSK7Q16549 785 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 ACOT1Q86TX2 421 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 CCT8L2Q96SF2 557 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 A0A1W2PQ67 120 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 CAND2O75155 1236 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 NEK2P51955 445 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 LONRF1Q17RB8 773 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 LONP2Q86WA8 852 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 C12orf56Q8IXR9 622 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 SEC16BQ96JE7 1060 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 POPDC2Q9HBU9 364 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 VPS28Q9UK41 221 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 ACOT9Q9Y305 439 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 CCT8L1PA6NM43 557 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 TRIM49D1C9J1S8 452 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 MYO1CO00159 1063 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF862O60290 1169 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms