RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548878.6

ARPC3-208, Transcript of actin related protein 2/3 complex subunit 3, human

TSL 5

Gene ARPC3, Length 532 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARPC3-208	ENST00000548878	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	CFHR3	Q02985	330 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	SLC13A2	Q13183	592 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	RAB32	Q13637	225 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	AWAT1	Q58HT5	328 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	CREB1	P16220	341 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	MTX1	Q13505	466 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	KCNB1	Q14721	858 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	PELI3	Q8N2H9	469 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	PJA1	Q8NG27	643 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	PHKB	Q93100	1093 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	TRIM5	Q9C035	493 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	BRAF	P15056	766 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	TIRAP	P58753	221 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	HYAL1	Q12794	435 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	STIM1	Q13586	685 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	STK32B	Q9NY57	414 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	PROCR	Q9UNN8	238 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	ANO9	A1A5B4	782 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	SPRY2	O43597	315 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	TGFB3	P10600	412 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	TACR3	P29371	465 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	UQCRC1	P31930	480 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	MTHFS	P49914	203 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	B4GALNT1	Q00973	533 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878		Q6ZTC4	211 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	MICU3	Q86XE3	530 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	HIC2	Q96JB3	615 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	CLIC1	O00299	241 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	MYL1	P05976	194 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	CD63	P08962	238 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	CPA2	P48052	419 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	TBX4	P57082	545 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	INSC	Q1MX18	579 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	KSR2	Q6VAB6	950 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	SESTD1	Q86VW0	696 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	MPP5	Q8N3R9	675 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	MAML1	Q92585	1016 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	COL20A1	Q9P218	1284 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ARPC3-208	ENST00000548878	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67

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