RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547188.1

PRDM4-202, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 3

Gene PRDM4, Length 640 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-202ENST00000547188 BROXQ5VW32 411 aa24.95■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 NT5DC4Q86YG4 428 aa24.95■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 LRRC52Q8N7C0 313 aa24.95■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 MED8Q96G25 268 aa24.95■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 C8orf48Q96LL4 319 aa24.95■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 KCND2Q9NZV8 630 aa24.95■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 IGLV3-19P01714 112 aa24.94■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 C1SP09871 688 aa24.94■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 ADSSP30520 456 aa24.94■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 MDH1BQ5I0G3 518 aa24.94■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 HECTD3Q5T447 861 aa24.94■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 HS2ST1Q7LGA3 356 aa24.94■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 ZNF248Q8NDW4 579 aa24.94■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa24.94■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 FBXO32Q969P5 355 aa24.94■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 PLK2Q9NYY3 685 aa24.94■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 FAM13AO94988 1023 aa24.93■■□□□ 1.58
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PRDM4-202ENST00000547188 CDK4P11802 303 aa24.93■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 YWHAQP27348 245 aa24.93■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 ACSL1P33121 698 aa24.93■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 COPAP53621 1224 aa24.93■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 SLFN12LQ6IEE8 588 aa24.93■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 ZHX3Q9H4I2 956 aa24.93■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 SIX4Q9UIU6 781 aa24.93■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 ODF2LQ9ULJ1 636 aa24.93■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 STYXL1Q9Y6J8 313 aa24.93■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 A0A1B0GTQ1 180 aa24.92■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 GLDCP23378 1020 aa24.92■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 EID2Q8N6I1 236 aa24.92■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 POMGNT1Q8WZA1 660 aa24.92■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 WDR35Q9P2L0 1181 aa24.92■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa24.92■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 LAD1O00515 517 aa24.91■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 GTF2BQ00403 316 aa24.91■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 ORC1Q13415 861 aa24.91■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 HYIQ5T013 277 aa24.91■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa24.91■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 BIRC7Q96CA5 298 aa24.91■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 FIZ1Q96SL8 496 aa24.91■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 FAM213AQ9BRX8 229 aa24.91■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 PCED1AQ9H1Q7 454 aa24.91■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 OSGEPQ9NPF4 335 aa24.91■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 MARK1Q9P0L2 795 aa24.91■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 PTPRJQ12913 1337 aa24.9■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 GREM1O60565 184 aa24.9■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 FSBPO95073 299 aa24.9■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 UCNP55089 124 aa24.9■■□□□ 1.58
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PRDM4-202ENST00000547188 DTHD1Q6ZMT9 781 aa24.9■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 GPBP1Q86WP2 473 aa24.9■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 P2RY11Q96G91 374 aa24.9■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP24.9■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa24.9■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 NACA2Q9H009 215 aa24.9■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 PARVGQ9HBI0 331 aa24.9■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 ITGA11Q9UKX5 1188 aa24.9■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 NME7Q9Y5B8 376 aa24.9■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 ITGAVP06756 1048 aa24.89■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 SCP2P22307 547 aa24.89■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 TRAPPC10P48553 1259 aa24.89■■□□□ 1.58
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PRDM4-202ENST00000547188 ZNF131P52739 623 aa24.89■■□□□ 1.58
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PRDM4-202ENST00000547188 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa24.89■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 KDM7AQ6ZMT4 941 aa24.89■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 HTR3DQ70Z44 454 aa24.89■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 LIMS2Q7Z4I7 341 aa24.89■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 NUP93Q8N1F7 819 aa24.89■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 PDZD8Q8NEN9 1154 aa24.89■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 SCAMP5Q8TAC9 235 aa24.89■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 TSC1Q92574 1164 aa24.89■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 SAAL1Q96ER3 474 aa24.89■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 C8orf76Q96K31 380 aa24.89■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 CLCA2Q9UQC9 943 aa24.89■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 CLDN5O00501 218 aa24.88■■□□□ 1.57
PRDM4-202ENST00000547188 ABCB4P21439 1286 aa24.88■■□□□ 1.57
PRDM4-202ENST00000547188 PRKCHP24723 683 aa24.88■■□□□ 1.57
PRDM4-202ENST00000547188 ENPP2Q13822 863 aa24.88■■□□□ 1.57
PRDM4-202ENST00000547188 SHBQ15464 509 aa24.88■■□□□ 1.57
PRDM4-202ENST00000547188 GEN1Q17RS7 908 aa24.88■■□□□ 1.57
PRDM4-202ENST00000547188 MTMR12Q9C0I1 747 aa24.88■■□□□ 1.57
PRDM4-202ENST00000547188 IGSF5Q9NSI5 407 aa24.88■■□□□ 1.57
PRDM4-202ENST00000547188 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
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