RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 ARHGAP17Q68EM7 881 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 ANO7Q6IWH7 933 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 IRGCQ6NXR0 463 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 ADGRD1Q6QNK2 874 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 PACS1Q6VY07 963 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 LIMS2Q7Z4I7 341 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 RNF180Q86T96 592 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 ZNF554Q86TJ5 538 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 EXOC3L1Q86VI1 746 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 CCDC105Q8IYK2 499 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 RCOR2Q8IZ40 523 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 ANKK1Q8NFD2 765 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 JOSD2Q8TAC2 188 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 C1orf54Q8WWF1 131 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 SLCO2A1Q92959 643 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 SLITRK1Q96PX8 696 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 HAPLN3Q96S86 360 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 CGREF1Q99674 301 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 SH3GL1Q99961 368 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 OSBPL8Q9BZF1 889 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 TRIM31Q9BZY9 425 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 DNAI2Q9GZS0 605 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 NEUROG2Q9H2A3 272 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 DPH5Q9H2P9 285 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 SNX25Q9H3E2 840 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 FAM49BQ9NUQ9 324 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 SLC38A7Q9NVC3 462 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 GMNCA6NCL1 334 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 E5RJQ4 531 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 HUS1O60921 280 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 PFDN1O60925 122 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 LRCH4O75427 683 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 TRPA1O75762 1119 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 FGFR1P11362 822 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 CPA3P15088 417 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 GBP1P32455 592 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 PTPN7P35236 360 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 MLH1P40692 756 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 KCNJ1P48048 391 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 SERPINB8P50452 374 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 LILRA4P59901 499 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 COPS2P61201 443 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 GSTM4Q03013 218 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 PTK7Q13308 1070 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 ITGA7Q13683 1181 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 SPIDRQ14159 915 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 ITIH4Q14624 930 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 ACAP1Q15027 740 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 PPP1R7Q15435 360 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 BCL2A1Q16548 175 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 CFAP157Q5JU67 520 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 CEP128Q6ZU80 1094 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 POLNQ7Z5Q5 900 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 TTC30AQ86WT1 665 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 ADGRF2Q8IZF7 708 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 CRYBG2Q8N1P7 616 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 TOP6BLQ8N6T0 577 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 EMC1Q8N766 993 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 APPL2Q8NEU8 664 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 RAET1EQ8TD07 263 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 PTPRN2Q92932 1015 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 LRRC45Q96CN5 670 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 ZFP42Q96MM3 310 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 FMO2Q99518 471 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 HEMGNQ9BXL5 484 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 DCLK3Q9C098 648 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 DPEP3Q9H4B8 488 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 CHST7Q9NS84 486 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 KLHL11Q9NVR0 708 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 PDP2Q9P2J9 529 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 HESX1Q9UBX0 185 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 ITM2BQ9Y287 266 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 GIT1Q9Y2X7 761 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 TMEM247A6NEH6 219 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 C2CD4BA6NLJ0 364 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 MEIS3P2A8K0S8 358 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 PI4K2BG5E9Z4 385 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 HCRTO43612 131 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 TRAPPC3O43617 180 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 KDM1AO60341 852 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 TJP3O95049 919 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 THP07101 528 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 KRT7P08729 469 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 PDGFRBP09619 1106 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-204ENST00000546621 GPD1P21695 349 aa8.08□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.1 ms