RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		12.42	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	SCD5	Q86SK9	330 aa		12.42	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	GPR149	Q86SP6	731 aa		12.42	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	DAAM2	Q86T65	1068 aa		12.42	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		12.42	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	RNF34	Q969K3	372 aa		12.42	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		12.42	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	CNPY3	Q9BT09	278 aa		12.42	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		12.42	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	12.42	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM51	Q9NW97	253 aa		12.42	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	COX16	Q9P0S2	106 aa		12.42	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		12.42	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	CD207	Q9UJ71	328 aa		12.42	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		12.42	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		12.42	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	UST	Q9Y2C2	406 aa		12.42	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		12.42	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658		M0QYT0	321 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	DPYSL4	O14531	572 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	SPOP	O43791	374 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	TADA3	O75528	432 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	F9	P00740	461 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	CKM	P06732	381 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	PFKL	P17858	780 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	FSHR	P23945	695 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	AVPR1A	P37288	418 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	PTPN9	P43378	593 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	EPHA5	P54756	1037 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	EFEMP1	Q12805	493 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	NME3	Q13232	169 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	ACAP1	Q15027	740 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	TCEAL1	Q15170	157 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	12.41	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	GPR158	Q5T848	1215 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	GAREM2	Q75VX8	874 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	TRIM58	Q8NG06	486 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	BTBD6	Q96KE9	485 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	GUCD1	Q96NT3	240 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	LRRC3	Q9BY71	257 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	IL21	Q9HBE4	155 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	DDIT4	Q9NX09	232 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	COG5	Q9UP83	839 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658		A0A0U1RQJ8	604 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	C2orf78	A6NCI8	922 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	PROSC	O94903	275 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	GJA1	P17302	382 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	SLC1A1	P43005	524 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	12.4	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	NTHL1	P78549	312 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	TEAD2	Q15562	447 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	CLUL1	Q15846	466 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	12.4	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	ODF2	Q5BJF6	829 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	TXNDC8	Q6A555	127 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	STRADA	Q7RTN6	431 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	TAC4	Q86UU9	113 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	MIB1	Q86YT6	1006 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF276	Q8N554	614 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	ING5	Q8WYH8	240 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	TBCB	Q99426	244 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	12.4	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	OSER1	Q9NX31	292 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	12.4	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	CLEC1B	Q9P126	229 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDB1-223	ENST00000543658	SLC12A8	A0AV02	714 aa		12.39	□□□□□ -0.43

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