RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534219.5

PTPRJ-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRJ, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-206ENST00000534219 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
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PTPRJ-206ENST00000534219 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
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PTPRJ-206ENST00000534219 VDRP11473 427 aa26.2■■□□□ 1.78
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PTPRJ-206ENST00000534219 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
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PTPRJ-206ENST00000534219 C10orf76Q5T2E6 689 aa26.2■■□□□ 1.78
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PTPRJ-206ENST00000534219 TMEM270Q6UE05 265 aa26.19■■□□□ 1.78
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PTPRJ-206ENST00000534219 UBA3Q8TBC4 463 aa26.19■■□□□ 1.78
PTPRJ-206ENST00000534219 BHMTQ93088 406 aa26.19■■□□□ 1.78
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PTPRJ-206ENST00000534219 MYH10P35580 1976 aa26.16■■□□□ 1.78
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PTPRJ-206ENST00000534219 C11orf74Q86VG3 221 aa26.16■■□□□ 1.78
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PTPRJ-206ENST00000534219 KCNH2Q12809 1159 aa26.15■■□□□ 1.78
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PTPRJ-206ENST00000534219 HMGB4Q8WW32 186 aa26.15■■□□□ 1.78
PTPRJ-206ENST00000534219 KAT5Q92993 513 aa26.15■■□□□ 1.78
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