RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528201.1

PACSIN3-204, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-204ENST00000528201 EFEMP1Q12805 493 aa25.14■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 CRY1Q16526 586 aa25.14■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 PKDCCQ504Y2 493 aa25.14■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 BTBD8Q5XKL5 378 aa25.14■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 PM20D1Q6GTS8 502 aa25.14■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 TMEM270Q6UE05 265 aa25.14■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 TPGS1Q6ZTW0 290 aa25.14■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 RASSF3Q86WH2 238 aa25.14■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 PPM1KQ8N3J5 372 aa25.14■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 TPSD1Q9BZJ3 242 aa25.14■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 MARK1Q9P0L2 795 aa25.14■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 DEC1Q9P2X7 70 aa25.14■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 RASAL2Q9UJF2 1139 aa25.14■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 INVSQ9Y283 1065 aa25.14■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 LRP3O75074 770 aa25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 ZBED1O96006 694 aa25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 HMBSP08397 361 aa25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 VDRP11473 427 aa25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 MARSP56192 900 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 LMNB2Q03252 620 aa25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 GOLGA8FQ08AF8 430 aa25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 CCDC6Q16204 474 aa25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 PLK5Q496M5 336 aa25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 ANO7Q6IWH7 933 aa25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 RRAGAQ7L523 313 aa25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 TERB1Q8NA31 727 aa25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 MDGA1Q8NFP4 955 aa25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 BBS2Q9BXC9 721 aa25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 CHMP5Q9NZZ3 219 aa25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 KIAA1468Q9P260 1216 aa25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 MYH10P35580 1976 aa25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 TBC1D3BA6NDS4 549 aa25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 P4HA2O15460 535 aa25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 CACNG3O60359 315 aa25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 TYRP14679 529 aa25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 DGKEP52429 567 aa25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 ADIGQ0VDE8 80 aa25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 BST2Q10589 180 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 KCNH2Q12809 1159 aa25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 CSRP2Q16527 193 aa25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 ERMP1Q7Z2K6 904 aa25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 TADA2BQ86TJ2 420 aa25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 BHMTQ93088 406 aa25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 KREMEN1Q96MU8 473 aa25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 EPN2O95208 641 aa25.11■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 PAEPP09466 180 aa25.11■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 BRD2P25440 801 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF132P52740 706 aa25.11■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 SLC8A3P57103 927 aa25.11■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 C10orf76Q5T2E6 689 aa25.11■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 LCLAT1Q6UWP7 414 aa25.11■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 PRR23CQ6ZRP0 262 aa25.11■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa25.11■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 ARHGAP18Q8N392 663 aa25.11■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 TRIML1Q8N9V2 468 aa25.11■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 EHBP1Q8NDI1 1231 aa25.11■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 MARCH2Q9P0N8 246 aa25.11■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 HESX1Q9UBX0 185 aa25.11■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 NCOR2Q9Y618 2525 aa25.1■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 AFPP02771 609 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 GRAMD4Q6IC98 578 aa25.1■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa25.1■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 LOXL4Q96JB6 756 aa25.1■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 PLK2Q9NYY3 685 aa25.1■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 WDR35Q9P2L0 1181 aa25.1■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 KIAA1257Q9ULG3 409 aa25.1■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 YJEFN3A6XGL0 299 aa25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 PRRT4C9JH25 899 aa25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 E7ENQ6 273 aa25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 GDF9O60383 454 aa25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 GNA14O95837 355 aa25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 CISD3P0C7P0 127 aa25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 SETSIPP0DME0 302 aa25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 BCKDHBP21953 392 aa25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 RGS7P49802 495 aa25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 ARHGAP8P85298 464 aa25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 SLC35F5Q8WV83 523 aa25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 KCTD13Q8WZ19 329 aa25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-204ENST00000528201 SMOC1Q9H4F8 434 aa25.09■■□□□ 1.61
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