RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527442.5

PKP3-205, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 3

Gene PKP3, Length 847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-205ENST00000527442 ACDQ96AP0 544 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 PANX2Q96RD6 677 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 SLC22A12Q96S37 553 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 INVSQ9Y283 1065 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 WNT6Q9Y6F9 365 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 PTMAP06454 111 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 ACO1P21399 889 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 GBP1P32455 592 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 SOX5P35711 763 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 STAT1P42224 750 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 DGKEP52429 567 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 GOLGA8FQ08AF8 430 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 FOXC1Q12948 553 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 USP4Q13107 963 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 DDR2Q16832 855 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 ARHGAP44Q17R89 818 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 TTC39CQ8N584 583 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 OSCP1Q8WVF1 389 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 TPSD1Q9BZJ3 242 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 AIPL1Q9NZN9 384 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 WASF3Q9UPY6 502 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 CNTN6Q9UQ52 1028 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 SNX9Q9Y5X1 595 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 AKAP13Q12802 2813 aa22.12■■□□□ 1.13
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PKP3-205ENST00000527442 IFNAR2P48551 515 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 TSPY1Q01534 308 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 INCA1Q0VD86 236 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 MEA1Q16626 185 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 CCDC142Q17RM4 750 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 PMS2CLQ68D20 193 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 DPH6Q7L8W6 267 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 FAM71AQ8IYT1 594 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 TOP6BLQ8N6T0 577 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 EXOC4Q96A65 974 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 CYP2S1Q96SQ9 504 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 SDCBP2Q9H190 292 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 SMYD3Q9H7B4 428 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 TRPC7Q9HCX4 862 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 SPEGQ15772 3267 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 TACC1O75410 805 aa22.11■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 FAM163BP0C2L3 166 aa22.11■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 FERP16591 822 aa22.11■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 CYP2F1P24903 491 aa22.11■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 EML3Q32P44 896 aa22.11■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 SFMBT2Q5VUG0 894 aa22.11■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 ATP2A3Q93084 1043 aa22.11■■□□□ 1.13
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PKP3-205ENST00000527442 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.1■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 TSTD1Q8NFU3 115 aa22.1■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 SPATA18Q8TC71 538 aa22.1■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 MYRFLQ96LU7 910 aa22.1■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 PKMYT1Q99640 499 aa22.1■■□□□ 1.13
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PKP3-205ENST00000527442 USP17L7P0C7H9 530 aa22.09■■□□□ 1.13
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PKP3-205ENST00000527442 MMS19Q96T76 1030 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 ADAM33Q9BZ11 813 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 ABCB6Q9NP58 842 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 TMEM9BQ9NQ34 198 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 ATRXP46100 2492 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 HUS1O60921 280 aa22.08■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 CILPO75339 1184 aa22.08■■□□□ 1.13
PKP3-205ENST00000527442 GFPT2O94808 682 aa22.08■■□□□ 1.13
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