RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515965.1

RNU6-377P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 377, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-377P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-377P-201ENST00000515965 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 FSCN3Q9NQT6 498 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 SEMA4GQ9NTN9 838 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 TLK1Q9UKI8 766 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 ADAM21Q9UKJ8 722 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 ASAP1Q9ULH1 1129 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 J3KTA2 159 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 CES2O00748 559 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 DNPH1O43598 174 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 PROP1O75360 226 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 EBLN1P0CF75 366 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 ADRA1DP25100 572 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 CHKAP35790 457 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 CYP4F2P78329 520 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 LMAN2Q12907 356 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 GRM4Q14833 912 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM153CQ494X1 144 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRIM60Q495X7 471 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMEM196Q5HYL7 178 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 CEP85Q6P2H3 762 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF804AQ7Z570 1209 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 NRSN1Q8IZ57 195 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 PNPLA1Q8N8W4 532 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 ATG16L2Q8NAA4 619 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 STT3BQ8TCJ2 826 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 VPS50Q96JG6 964 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 SNX18Q96RF0 628 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 PSMD1Q99460 953 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 HERPUD2Q9BSE4 406 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 MRIQ9BWK5 157 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 MAGEH1Q9H213 219 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 KLK15Q9H2R5 256 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRDM13Q9H4Q3 707 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 IL17RBQ9NRM6 502 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 DACT1Q9NYF0 836 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 SEMA5BQ9P283 1151 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 LPAR3Q9UBY5 353 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 INSL6Q9Y581 213 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 GXYLT2A0PJZ3 443 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM90A18PA6NE21 464 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 PLEKHD1A6NEE1 506 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM90A16PA6NEW6 464 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 TARM1B6A8C7 271 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 H3BNC9 293 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 ACKR2O00590 384 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 CTIFO43310 598 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 SUV39H1O43463 412 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 ASNA1O43681 348 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 PIP5K1CO60331 668 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 JTBO76095 146 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 PDE8BO95263 885 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 TNFRSF6BO95407 300 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 MBPP02686 304 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM90A15PP0C7V4 464 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM90A14PP0C7W9 464 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 FPR3P25089 353 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 HALP42357 657 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 GRK6P43250 576 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 CDK7P50613 346 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 PNLIPRP1P54315 467 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 GPC5P78333 572 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 CFHR3Q02985 330 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 SEMA3BQ13214 749 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 TSTD2Q5T7W7 516 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 DENND2CQ68D51 928 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 MSANTD2Q6P1R3 559 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC29A4Q7RTT9 530 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 TTC30AQ86WT1 665 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 GATAD2AQ86YP4 633 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 TERB1Q8NA31 727 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 WDR60Q8WVS4 1066 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 SARAFQ96BY9 339 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 EPS8L2Q9H6S3 715 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 SAP30LQ9HAJ7 183 aa3.12□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms