RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515835.2

PDE4D-225, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene PDE4D, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-225ENST00000515835 KLHL32Q96NJ5 620 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 FAM204AQ9H8W3 233 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 GPR35Q9HC97 309 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 DKK2Q9UBU2 259 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 FLT1P17948 1338 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 TMEM200CA6NKL6 621 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 FAM227AF5H4B4 570 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 IDH1O75874 414 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 NDUFA10O95299 355 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 GPANK1O95872 356 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 CHEK2O96017 543 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 ELANEP08246 267 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 RARBP10826 455 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 BACE1P56817 501 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 GBX1Q14549 363 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 SPDYE7PQ495Y7 208 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 TIGD2Q4W5G0 525 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 EMC10Q5UCC4 262 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 ADGRA1Q86SQ6 560 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 AACSQ86V21 672 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 TMIEQ8NEW7 156 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 C8orf48Q96LL4 319 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 ZSWIM1Q9BR11 485 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 SLAMF7Q9NQ25 335 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 OBP2AQ9NY56 170 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 KCNE5Q9UJ90 142 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 MYH13Q9UKX3 1938 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 NARSO43776 548 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 MYBP10242 640 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 TACR2P21452 398 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 HMGCS2P54868 508 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 HSD11B2P80365 405 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 PRKCZQ05513 592 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 TATDN1Q6P1N9 297 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 NPNTQ6UXI9 565 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 SLC17A8Q8NDX2 589 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 BOD1Q96IK1 185 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 TLR10Q9BXR5 811 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 B3GNT5Q9BYG0 378 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 IMPG2Q9BZV3 1241 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 SIK2Q9H0K1 926 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 DNAJC18Q9H819 358 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 ARMT1Q9H993 441 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 RSAD1Q9HA92 442 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 TMOD4Q9NZQ9 345 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 HSFX1Q9UBD0 423 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 MORF4L1Q9UBU8 362 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 USP25Q9UHP3 1055 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 CCDC78A2IDD5 438 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 NPIPB8E9PQR5 432 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF202O95125 648 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 AHSGP02765 367 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 CCL5P13501 91 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 MAKP20794 623 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 PIGFQ07326 219 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF844Q08AG5 666 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 RESTQ13127 1097 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 TREML2Q5T2D2 321 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 MRGPREQ86SM8 312 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 DOCK2Q92608 1830 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 C12orf42Q96LP6 360 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 TMEM74BQ9NUR3 256 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 GABRQQ9UN88 632 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 CDYLQ9Y232 598 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 NEU2Q9Y3R4 380 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 NOX1Q9Y5S8 564 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 HS3ST4Q9Y661 456 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 CENPFP49454 3210 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 CAPN8A6NHC0 703 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF785A8K8V0 405 aa7.13□□□□□ -1.27
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