RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 SPTBN2O15020 2390 aa20.28■□□□□ 0.84
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SH3BP2-220ENST00000511663 A0A1W2PQ27 194 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-220ENST00000511663 A0A1W2PQ64 194 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-220ENST00000511663 A0A1W2PQD8 194 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-220ENST00000511663 PATE3B3GLJ2 98 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-220ENST00000511663 HHLA1C9JL84 531 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-220ENST00000511663 CILPO75339 1184 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-220ENST00000511663 WASP42768 502 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-220ENST00000511663 DGKGP49619 791 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-220ENST00000511663 MAP7D1Q3KQU3 841 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF394Q53GI3 561 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-220ENST00000511663 LYSMD4Q5XG99 296 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-220ENST00000511663 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-220ENST00000511663 ABCA7Q8IZY2 2146 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-220ENST00000511663 FAXDC2Q96IV6 333 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-220ENST00000511663 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-220ENST00000511663 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP20.28■□□□□ 0.84
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SH3BP2-220ENST00000511663 CHKAP35790 457 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-220ENST00000511663 KIF11P52732 1056 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-220ENST00000511663 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
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SH3BP2-220ENST00000511663 MARK1Q9P0L2 795 aa20.27■□□□□ 0.84
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SH3BP2-220ENST00000511663 PTGER3P43115 390 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 SHC2P98077 582 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 EDRF1Q3B7T1 1238 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC186Q7Z3E2 898 aa20.26■□□□□ 0.83
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SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF276Q8N554 614 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 FBXL13Q8NEE6 735 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 CEP76Q8TAP6 659 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM176AQ96HP8 235 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 DCLK3Q9C098 648 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 RAB20Q9NX57 234 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 CLIC5Q9NZA1 410 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
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SH3BP2-220ENST00000511663 E2F5Q15329 346 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
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SH3BP2-220ENST00000511663 SLC32A1Q9H598 525 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 RMND1Q9NWS8 449 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 RASAL2Q9UJF2 1139 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 STRIP2Q9ULQ0 834 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 ZDHHC9Q9Y397 364 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 NUP205Q92621 2012 aa20.25■□□□□ 0.83
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SH3BP2-220ENST00000511663 GFRA2O00451 464 aa20.24■□□□□ 0.83
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SH3BP2-220ENST00000511663 DUOXA1Q1HG43 343 aa20.24■□□□□ 0.83
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SH3BP2-220ENST00000511663 SLC23A3Q6PIS1 610 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 DEFB119Q8N690 84 aa20.24■□□□□ 0.83
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SH3BP2-220ENST00000511663 TSG101Q99816 390 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 CISHQ9NSE2 258 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM74BQ9NUR3 256 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC6A14Q9UN76 642 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 USP3Q9Y6I4 520 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 STC2O76061 302 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 ENGP17813 658 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 ITPKAP23677 461 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF33AQ06730 810 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 EFEMP1Q12805 493 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa20.23■□□□□ 0.83
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