RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 M0QZQ0 153 aa11.23□□□□□ -0.61
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SH3BP2-209ENST00000504450 MCF2LO15068 1137 aa11.23□□□□□ -0.61
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SH3BP2-209ENST00000504450 NOS2P35228 1153 aa11.23□□□□□ -0.61
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SH3BP2-209ENST00000504450 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
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SH3BP2-209ENST00000504450 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP2-209ENST00000504450 USP3Q9Y6I4 520 aa11.23□□□□□ -0.61
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SH3BP2-209ENST00000504450 NRP1O14786 923 aa11.22□□□□□ -0.61
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SH3BP2-209ENST00000504450 FAM200BP0CF97 657 aa11.22□□□□□ -0.61
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SH3BP2-209ENST00000504450 ODC1P11926 461 aa11.21□□□□□ -0.61
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SH3BP2-209ENST00000504450 TYMPP19971 482 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP2-209ENST00000504450 PCSK1P29120 753 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP2-209ENST00000504450 MAGEA6P43360 314 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP2-209ENST00000504450 SLCO1A2P46721 670 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP2-209ENST00000504450 BRCC3P46736 316 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP2-209ENST00000504450 NR2C2P49116 596 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP2-209ENST00000504450 SULT1E1P49888 294 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP2-209ENST00000504450 CACNA2D1P54289 1103 aa11.21□□□□□ -0.61
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