RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495428.5

CMC1-211, Transcript of C-X9-C motif containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene CMC1, Length 608 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1-211ENST00000495428 FZD4Q9ULV1 537 aa3.8□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 WDR47O94967 919 aa3.79□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 BMP15O95972 392 aa3.79□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 ATICP31939 592 aa3.79□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 MTAPQ13126 283 aa3.79□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 ACOX1Q15067 660 aa3.79□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 SEC23BQ15437 767 aa3.79□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 RRAGBQ5VZM2 374 aa3.79□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 ANO7Q6IWH7 933 aa3.79□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 KRT73Q86Y46 540 aa3.79□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 NANOGP1Q8N7R0 232 aa3.79□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 FAM71DQ8N9W8 422 aa3.79□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 SUN3Q8TAQ9 357 aa3.79□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 C8orf48Q96LL4 319 aa3.79□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 COLEC11Q9BWP8 271 aa3.79□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 AS3MTQ9HBK9 375 aa3.79□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 ELOVL5Q9NYP7 299 aa3.79□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 PI4KBQ9UBF8 816 aa3.79□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 A0A087WZ62 844 aa3.78□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 POM121BA6NF01 834 aa3.78□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 FYB1O15117 783 aa3.78□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 CA12O43570 354 aa3.78□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 PRAMEF2O60811 474 aa3.78□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 FGBP02675 491 aa3.78□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 IGKV2-30P06310 120 aa3.78□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 SLC5A1P13866 664 aa3.78□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 TSHRP16473 764 aa3.78□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 FGFR2P21802 821 aa3.78□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 CASP5P51878 434 aa3.78□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 DGKQP52824 942 aa3.78□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 CCDC15Q0P6D6 951 aa3.78□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 SLC14A1Q13336 389 aa3.78□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 DNASE1L3Q13609 305 aa3.78□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 FHL3Q13643 280 aa3.78□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 LAMB3Q13751 1172 aa3.78□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 RABEP1Q15276 862 aa3.78□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 FAXCQ5TGI0 409 aa3.78□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa3.78□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 GRHL2Q6ISB3 625 aa3.78□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 USP17L6PQ6QN14 398 aa3.78□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 BEND5Q7L4P6 421 aa3.78□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 P3H2Q8IVL5 708 aa3.78□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 ZNF366Q8N895 744 aa3.78□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 RNF152Q8N8N0 203 aa3.78□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 C16orf52Q8NHV5 167 aa3.78□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 ABHD5Q8WTS1 349 aa3.78□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 HMCESQ96FZ2 354 aa3.78□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 SIGLEC11Q96RL6 698 aa3.78□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 SARGQ9BW04 601 aa3.78□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 ADGRE3Q9BY15 652 aa3.78□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 MAGEB5Q9BZ81 275 aa3.78□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 TMOD4Q9NZQ9 345 aa3.78□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 SEMA5BQ9P283 1151 aa3.78□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 MYO1AQ9UBC5 1043 aa3.78□□□□□ -1.8
CMC1-211ENST00000495428 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa3.77□□□□□ -1.81
CMC1-211ENST00000495428 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
CMC1-211ENST00000495428 A0A1W2PPC4 97 aa3.77□□□□□ -1.81
CMC1-211ENST00000495428 KIF3BO15066 747 aa3.77□□□□□ -1.81
CMC1-211ENST00000495428 KPNA5O15131 536 aa3.77□□□□□ -1.81
CMC1-211ENST00000495428 KCNQ3O43525 872 aa3.77□□□□□ -1.81
CMC1-211ENST00000495428 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
CMC1-211ENST00000495428 COQ9O75208 318 aa3.77□□□□□ -1.81
CMC1-211ENST00000495428 ARP10275 920 aa3.77□□□□□ -1.81
CMC1-211ENST00000495428 MYL4P12829 197 aa3.77□□□□□ -1.81
CMC1-211ENST00000495428 TACR3P29371 465 aa3.77□□□□□ -1.81
CMC1-211ENST00000495428 SLC5A2P31639 672 aa3.77□□□□□ -1.81
CMC1-211ENST00000495428 GALNSP34059 522 aa3.77□□□□□ -1.81
CMC1-211ENST00000495428 NR4A2P43354 598 aa3.77□□□□□ -1.81
CMC1-211ENST00000495428 STT3AP46977 705 aa3.77□□□□□ -1.81
CMC1-211ENST00000495428 JAK3P52333 1124 aa3.77□□□□□ -1.81
CMC1-211ENST00000495428 HSF1Q00613 529 aa3.77□□□□□ -1.81
CMC1-211ENST00000495428 CFHR1Q03591 330 aa3.77□□□□□ -1.81
CMC1-211ENST00000495428 GPS1Q13098 491 aa3.77□□□□□ -1.81
CMC1-211ENST00000495428 KCNJ12Q14500 433 aa3.77□□□□□ -1.81
CMC1-211ENST00000495428 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
CMC1-211ENST00000495428 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
CMC1-211ENST00000495428 COBLL1Q53SF7 1204 aa3.77□□□□□ -1.81
CMC1-211ENST00000495428 C10orf25Q5T742 122 aa3.77□□□□□ -1.81
CMC1-211ENST00000495428 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa3.77□□□□□ -1.81
CMC1-211ENST00000495428 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
CMC1-211ENST00000495428 MRNIPQ6NTE8 343 aa3.77□□□□□ -1.81
CMC1-211ENST00000495428 SHC4Q6S5L8 630 aa3.77□□□□□ -1.81
CMC1-211ENST00000495428 CRTC1Q6UUV9 634 aa3.77□□□□□ -1.81
CMC1-211ENST00000495428 DEF8Q6ZN54 512 aa3.77□□□□□ -1.81
CMC1-211ENST00000495428 CCDC33Q8N5R6 958 aa3.77□□□□□ -1.81
CMC1-211ENST00000495428 CCDC150Q8NCX0 1101 aa3.77□□□□□ -1.81
CMC1-211ENST00000495428 LRRC46Q96FV0 321 aa3.77□□□□□ -1.81
CMC1-211ENST00000495428 WDR24Q96S15 920 aa3.77□□□□□ -1.81
CMC1-211ENST00000495428 VPS45Q9NRW7 570 aa3.77□□□□□ -1.81
CMC1-211ENST00000495428 MTMR4Q9NYA4 1195 aa3.77□□□□□ -1.81
CMC1-211ENST00000495428 FAM50BQ9Y247 325 aa3.77□□□□□ -1.81
CMC1-211ENST00000495428 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa3.77□□□□□ -1.81
CMC1-211ENST00000495428 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
CMC1-211ENST00000495428 SOCS2O14508 198 aa3.76□□□□□ -1.81
CMC1-211ENST00000495428 ADAM10O14672 748 aa3.76□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms