RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BPTFQ12830 3046 aa16.13■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COL1A2P08123 1366 aa16.13■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MGRN1O60291 552 aa16.13■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FLT3LGP49771 235 aa16.13■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OASLQ15646 514 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC14Q49A88 953 aa16.13■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FBXO47Q5MNV8 452 aa16.13■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRIM68Q6AZZ1 485 aa16.13■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LVRNQ6Q4G3 990 aa16.13■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP16.13■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FBXO36Q8NEA4 188 aa16.13■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRRC8CQ8TDW0 803 aa16.13■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BATF3Q9NR55 127 aa16.13■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LGALS13Q9UHV8 139 aa16.13■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STRIP2Q9ULQ0 834 aa16.13■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDY2AQ9Y6F7 541 aa16.13■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KPNA7A9QM74 516 aa16.12■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPX6P59796 221 aa16.12■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WSCD1Q658N2 575 aa16.12■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BEST2Q8NFU1 509 aa16.12■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa16.12■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPATA18Q8TC71 538 aa16.12■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FBF1Q8TES7 1133 aa16.12■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa16.12■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LHX5Q9H2C1 402 aa16.12■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM165Q9HC07 324 aa16.12■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RRN3P2A6NIE6 340 aa16.12■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AOC2O75106 756 aa16.12■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POMCP01189 267 aa16.12■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PYGBP11216 843 aa16.12■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPD1P21695 349 aa16.12■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPL22P35268 128 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRKCZQ05513 592 aa16.12■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPARCL1Q14515 664 aa16.12■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MTFR1Q15390 333 aa16.12■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AGAP11Q8TF27 550 aa16.12■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CPT1BQ92523 772 aa16.12■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MYLK2Q9H1R3 596 aa16.12■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HAO1Q9UJM8 370 aa16.12■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NUP205Q92621 2012 aa16.12■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PTGESO14684 152 aa16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADRA1DP25100 572 aa16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FKBP1BP68106 108 aa16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC5A9Q2M3M2 681 aa16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM131BQ86XD5 332 aa16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C3orf58Q8NDZ4 430 aa16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KCNV2Q8TDN2 545 aa16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PIDD1Q9HB75 910 aa16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NPHS2Q9NP85 383 aa16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM63AO94886 807 aa16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HMGCRP04035 888 aa16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LINGO3P0C6S8 592 aa16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RBP3P10745 1247 aa16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POU5F1BQ06416 359 aa16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KRT81Q14533 505 aa16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MORF4L2Q15014 288 aa16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HADHQ16836 314 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LCLAT1Q6UWP7 414 aa16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MCRS1Q96EZ8 462 aa16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HESX1Q9UBX0 185 aa16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C2CD4BA6NLJ0 364 aa16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ASMTLO95671 621 aa16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GSTA1P08263 222 aa16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATICP31939 592 aa16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RGS2P41220 211 aa16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADAM17P78536 824 aa16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 INCA1Q0VD86 236 aa16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIAA0319Q5VV43 1072 aa16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKLE1Q8NAG6 615 aa16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PGLYRP2Q96PD5 576 aa16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KCNK16Q96T55 309 aa16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TSC22D3Q99576 134 aa16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EPAS1Q99814 870 aa16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RXFP1Q9HBX9 757 aa16.11■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLUHO75153 1309 aa16.1■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 H7C0C1 242 aa16.1■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRPSAP2O60256 369 aa16.1■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATP5OP48047 213 aa16.1■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CPT1AP50416 773 aa16.1■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SCNN1GP51170 649 aa16.1■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.5 ms