RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482651.5

HDGF-208, Transcript of heparin binding growth factor, human

TSL 3

Gene HDGF, Length 966 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDGF-208	ENST00000482651	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		9.27	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	DNAJC6	O75061	913 aa		9.27	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	USP17L7	P0C7H9	530 aa		9.27	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	TRIM49	P0CI25	452 aa		9.27	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	TRIM49C	P0CI26	452 aa		9.27	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	PFKL	P17858	780 aa		9.27	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	SOX9	P48436	509 aa		9.27	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	PPP3CC	P48454	512 aa		9.27	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	PDE6C	P51160	858 aa		9.27	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	CACNA2D1	P54289	1103 aa		9.27	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	FOXK2	Q01167	660 aa		9.27	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	PPP3CA	Q08209	521 aa		9.27	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	KCNJ12	Q14500	433 aa		9.27	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		9.27	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	KRT39	Q6A163	491 aa		9.27	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	FAM35A	Q86V20	835 aa		9.27	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		9.27	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	MYO19	Q96H55	970 aa		9.27	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		9.27	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		9.27	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	CHRD	Q9H2X0	955 aa		9.27	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		9.27	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		9.27	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	GKN1	Q9NS71	199 aa		9.27	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		9.27	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		9.27	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		9.27	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	GCNT4	Q9P109	453 aa		9.27	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	COL4A2	P08572	1712 aa		9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	C2orf78	A6NCI8	922 aa		9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	CLDN5	O00501	218 aa		9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	P4HA2	O15460	535 aa		9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	PEX14	O75381	377 aa		9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	CKM	P06732	381 aa		9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	CHRNB1	P11230	501 aa		9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	ASPA	P45381	313 aa		9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	GCLM	P48507	274 aa		9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	NDST1	P52848	882 aa		9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	TNK2	Q07912	1038 aa		9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	MTAP	Q13126	283 aa		9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	RUNX3	Q13761	415 aa		9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	LRRC32	Q14392	662 aa		9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	MTF1	Q14872	753 aa		9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	ZNF77	Q15935	545 aa		9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	MAN2A1	Q16706	1144 aa		9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	WDR44	Q5JSH3	913 aa		9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	ACOT1	Q86TX2	421 aa		9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	UNC93A	Q86WB7	457 aa		9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	TTC8	Q8TAM2	541 aa		9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	RIN3	Q8TB24	985 aa		9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	FAM81B	Q96LP2	452 aa		9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	SLC22A12	Q96S37	553 aa		9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	MED10	Q9BTT4	135 aa		9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	HPS4	Q9NQG7	708 aa		9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	FANCL	Q9NW38	375 aa		9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651		R4GN57	208 aa		9.26	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		9.25	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	USP27X	A6NNY8	438 aa		9.25	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	PMM2	O15305	246 aa		9.25	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	SERPINC1	P01008	464 aa		9.25	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	ARSA	P15289	507 aa		9.25	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	HDC	P19113	662 aa		9.25	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	YWHAQ	P27348	245 aa		9.25	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	MXI1	P50539	228 aa		9.25	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	CCR3	P51677	355 aa		9.25	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	INCA1	Q0VD86	236 aa		9.25	□□□□□ -0.93
HDGF-208	ENST00000482651	PDGFRL	Q15198	375 aa		9.25	□□□□□ -0.93

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